W&T Wetenschap & Technologie
Een plek om te discussiëren over wetenschappelijke onderwerpen, wetenschappelijke problemen, technologische projecten en grootse uitvindingen.
Dat gevoel heb ik ook. Ik leer nu in een noodtempo om ideeën te genereren, onderzoek op te zetten en mensen aan te sturen.quote:Op dinsdag 3 februari 2015 10:00 schreef Lyrebird het volgende:
Je leert het vak pas echt als je zelf verantwoordelijk bent.
Inmiddels ben ik van een tweede aio dagelijks begeleider en binnen een half jaar misschien van nog een derde. Ik denk dat ik daarna maar eens 'nee' moet gaan zeggen.
Wat is eigenlijk een gebruikelijk aantal om mee te begeleiden?
I make it a thing, to glance in window panes and look pleased with myself.
Dan moet daar wel geld voor zijn (en dat was er bv bij mijn PhD plek absoluut niet, al had ik daar best even willen blijven).quote:Op dinsdag 3 februari 2015 20:39 schreef Claudia_x het volgende:
Mijn advies zou zijn: blijf in de buurt. Neem wat kleine docent- of onderzoekstaken aan en dan komt de postdocplek er vast wel. Het is heel cru, maar over het algemeen is het uit het oog, uit het hart.
Mijn laatste twee postdocs zijn binnengekomen van mijn network/tegengekomen op een congres, en eentje reageerde op een tweet dat ik nieuwe postdocs zocht. Het kan raar lopen. Ik post ook wel eens op Nature Jobs maar dat is heel erg hit-or-miss en kost relatief veel tijd.
Jesus saves but death prevails.
Ik ben administrator van een mailing list op mijn vakgebied. Daar komen ook regelmatig job postings voorbij, dus als je een baan zoekt valt het aan te raden lid te worden van zulke mailing lists (heck als ik graag een baan zou willen kan ik ze achterhouden en er zelf op reageren, hehe).
They told me all of my cages were mental, so I got wasted like all my potential.
Aantal aanmeldingen: 1quote:
Ik ben administrator van een mailing list op mijn vakgebied. Daar komen ook regelmatig job postings voorbij, dus als je een baan zoekt valt het aan te raden lid te worden van zulke mailing lists (heck als ik graag een baan zou willen kan ik ze achterhouden en er zelf op reageren, hehe).
CV: Admin mailinglijst.
I am a Chinese college students, I have a loving father, but I can not help him, he needs to do heart bypass surgery, I can not help him, because the cost of 100,000 or so needed, please help me, lifelong You pray Thank you!
Yep, dat is in mijn gebied ook het geval. Die listings hou ik ook in de gaten. Ik maak het me natuurlijk ook wel een stuk moeilijker door binnen een forensbare straal van Nijmegen te zoeken ivm mijn vriendin die hier net met een PhD begintquote:
Ik ben administrator van een mailing list op mijn vakgebied. Daar komen ook regelmatig job postings voorbij, dus als je een baan zoekt valt het aan te raden lid te worden van zulke mailing lists (heck als ik graag een baan zou willen kan ik ze achterhouden en er zelf op reageren, hehe).
Er was al iemand in Detroit die me heel graag wou hebben, en volgens mij was er in Leipzig ook wel een plekje.
Egregious professor of Cruel and Unusual Geography
Onikaan ni ov dovah
Onikaan ni ov dovah
Wat alles nog extra moeilijk maakt is dat ze me hier helemaal niets aan mogen bieden zolang het boekje nog niet af en goedgekeurd is.quote:
Mijn advies zou zijn: blijf in de buurt. Neem wat kleine docent- of onderzoekstaken aan en dan komt de postdocplek er vast wel. Het is heel cru, maar over het algemeen is het uit het oog, uit het hart.
Egregious professor of Cruel and Unusual Geography
Onikaan ni ov dovah
Onikaan ni ov dovah
Apart! Is dat iets Nederlands? Of een intern iets? Leipzig is wel leuk trouwens! MPI?quote:
[..]
Wat alles nog extra moeilijk maakt is dat ze me hier helemaal niets aan mogen bieden zolang het boekje nog niet af en goedgekeurd is.
Een relatie is altijd lastig met zoiets. Wij hebben ook dat "two body problem" en ik ben zo ontzettend blij dat mijn (toen nog) vriendin ook een postdoc heeft gevonden. De laatste dag van haar 90 dagen visum weliswaar, maar toch.
Lijkt mij niet ik ken er genoeg die al aan de slag zijn gegaan terwijl hun boekje nog niet klaar ben. Ik ken zelfs iemand met een nogal drukke baan waardoor ik denk dat haar boekje nooit af gaat komen...quote:
[..]
Apart! Is dat iets Nederlands? Of een intern iets? Leipzig is wel leuk trouwens! MPI?
Een relatie is altijd lastig met zoiets. Wij hebben ook dat "two body problem" en ik ben zo ontzettend blij dat mijn (toen nog) vriendin ook een postdoc heeft gevonden. De laatste dag van haar 90 dagen visum weliswaar, maar toch.
En mochten we vallen dan is het omhoog. - Krang (uit: Pantani)
My favourite music is the music I haven't yet heard - John Cage
Water: ijskoud de hardste - Gehenna
My favourite music is the music I haven't yet heard - John Cage
Water: ijskoud de hardste - Gehenna
Dat is iets van de universiteit hier. Het idee erachter is dat mensen het behalen van hun phd schijnbaar zo lang mogelijk uit aan het stellen waren door de tijd te vullen met RA baantjes om een zo hoog mogelijke h-index op te bouwen voor de Veni aanvraag. Dat willen ze met deze maatregel dus tegen gaan.quote:
[..]
Apart! Is dat iets Nederlands? Of een intern iets? Leipzig is wel leuk trouwens! MPI?
Een relatie is altijd lastig met zoiets. Wij hebben ook dat "two body problem" en ik ben zo ontzettend blij dat mijn (toen nog) vriendin ook een postdoc heeft gevonden. De laatste dag van haar 90 dagen visum weliswaar, maar toch.
Egregious professor of Cruel and Unusual Geography
Onikaan ni ov dovah
Onikaan ni ov dovah
Dat komt door die in mijn ogen veel te korte tijdspanne dat je de veni kunt aanvragen... 2 jaar als je van onderwerp switcht dan is dat amper tijd om een leuk setje artiekelen van het onderwerp te schrijven en voorwerk te doen. Bij mij was die 2 jaar dan ook veel te kortquote:
[..]
Dat is iets van de universiteit hier. Het idee erachter is dat mensen het behalen van hun phd schijnbaar zo lang mogelijk uit aan het stellen waren door de tijd te vullen met RA baantjes om een zo hoog mogelijke h-index op te bouwen voor de Veni aanvraag. Dat willen ze met deze maatregel dus tegen gaan.
En mochten we vallen dan is het omhoog. - Krang (uit: Pantani)
My favourite music is the music I haven't yet heard - John Cage
Water: ijskoud de hardste - Gehenna
My favourite music is the music I haven't yet heard - John Cage
Water: ijskoud de hardste - Gehenna
Ik dacht dat het binnen 3 jaar van het behalen van je doctoraat was?quote:Op woensdag 4 februari 2015 10:48 schreef Bosbeetle het volgende:
[..]
Dat komt door die in mijn ogen veel te korte tijdspanne dat je de veni kunt aanvragen... 2 jaar als je van onderwerp switcht dan is dat amper tijd om een leuk setje artiekelen van het onderwerp te schrijven en voorwerk te doen. Bij mij was die 2 jaar dan ook veel te kort
Egregious professor of Cruel and Unusual Geography
Onikaan ni ov dovah
Onikaan ni ov dovah
Oh dat kan ook.. in mijn geval nog te kort.. omdat het mij een jaar duurde om mijn post-doc te krijgen. Voor mijn gevoel zit ik nu op het punt dat ik geld zou moeten schrijven maar alle beursen voor beginnende wetenschapper zijn voor mij al voorbij. Ik snap niet hoe ik het voor elkaar had moeten krijgen om al veel eerder zoveel voorwerk klaar te hebben liggen. Bijkomend probleem is dat ik inmiddels niet aan één model werk maar meer aan één techniek en niet de ontwikkeling van die techniek doe maar wel de relatief gespecialiseerde uitvoering van die techniek.quote:
[..]
Ik dacht dat het binnen 3 jaar van het behalen van je doctoraat was?
#myscientificcarreerisscrewed
En mochten we vallen dan is het omhoog. - Krang (uit: Pantani)
My favourite music is the music I haven't yet heard - John Cage
Water: ijskoud de hardste - Gehenna
My favourite music is the music I haven't yet heard - John Cage
Water: ijskoud de hardste - Gehenna
Join the club.Er zijn grofweg twee modellen voor een loopbaan in de wetenschap.
In de eerste ga je naar een goede universiteit, haal je goede cijfers, word je aangenomen in een goede groep met een goede promotor. Je schrijft een aantal artikelen, en op basis daarvan krijg je een assistant professorship op een goede universiteit met goede studenten, die het materiaal aanleveren waarmee je grants binnenhaalt, waarmee je goede promovendi en postdocs kunt aannemen. Tenure? Een makkie.
In het tweede model zit het allemaal wat minder mee, en wordt er qua improvisatie wat meer van je gevraagd om mee te kunnen blijven doen. Ik denk dat we wat dat betreft in hetzelfde schuitje zitten (wbt grants staat bij mij de teller nog steeds op $0 - o ja, en ik had de universiteit waar ik promoveerde maar liefst twee keer eerder bezocht voordat ik er promoveerde). Tip: ga van de bewandelde paden af, want die zijn bedoeld voor mensen die in het eerste model zitten. Maar er zijn gelukkig veel meer paden beschikbaar, er zijn meer mogelijkheden om geld binnen te harken dan een Veni. Waar ben je erg goed in, en wie is er in geinteresseerd om daar een hoop geld aan uit te geven?
[ Bericht 1% gewijzigd door Lyrebird op 04-02-2015 13:17:12 ]
Good intentions and tender feelings may do credit to those who possess them, but they often lead to ineffective — or positively destructive — policies ... Kevin D. Williamson
Helemaal niet? Ik zie dat aan steeds meer universiteiten junior docenten worden aangesteld. Voor veel onderwijstaken zoals begeleiding van bachelorscripties en tutor zijn van werkgroepen wordt specifiek om net afgestudeerden of beginnend onderzoekers gevraagd. Kun je niet alvast naar zoiets uitkijken, eventueel aan een andere universiteit? (Ik neem aan dat het dan vooral gaat om Utrecht?)quote:
[..]
Wat alles nog extra moeilijk maakt is dat ze me hier helemaal niets aan mogen bieden zolang het boekje nog niet af en goedgekeurd is.
I make it a thing, to glance in window panes and look pleased with myself.
Veldwerk 
Vanochtend bij een nieuwe organisatie begonnen, en wat is het leuk!!
#nietsbijtedragenaanderestvandediscussie
Vanochtend bij een nieuwe organisatie begonnen, en wat is het leuk!!
#nietsbijtedragenaanderestvandediscussie
Ja doei.
Hou dat vastquote:
En mochten we vallen dan is het omhoog. - Krang (uit: Pantani)
My favourite music is the music I haven't yet heard - John Cage
Water: ijskoud de hardste - Gehenna
My favourite music is the music I haven't yet heard - John Cage
Water: ijskoud de hardste - Gehenna
Hier lopen ook veel MRI mensen rond hè? Kennen jullie een voorbeeld waar je 1 type signaal registreerd en vervolgens naar een ander type signaal kijkt (lijkt me geen rare techniek) en hebben jullie een artikel waarin dat gebruikt wordt.
Mijn zoekterm opties raken een beetje op.
Mijn zoekterm opties raken een beetje op.
En mochten we vallen dan is het omhoog. - Krang (uit: Pantani)
My favourite music is the music I haven't yet heard - John Cage
Water: ijskoud de hardste - Gehenna
My favourite music is the music I haven't yet heard - John Cage
Water: ijskoud de hardste - Gehenna
Helemaal niet inderdaad. Daarom ben ik nu ook bij andere locaties aan het kijken zoals Utrecht en Eindhoven.quote:
[..]
Helemaal niet? Ik zie dat aan steeds meer universiteiten junior docenten worden aangesteld. Voor veel onderwijstaken zoals begeleiding van bachelorscripties en tutor zijn van werkgroepen wordt specifiek om net afgestudeerden of beginnend onderzoekers gevraagd. Kun je niet alvast naar zoiets uitkijken, eventueel aan een andere universiteit? (Ik neem aan dat het dan vooral gaat om Utrecht?)
Egregious professor of Cruel and Unusual Geography
Onikaan ni ov dovah
Onikaan ni ov dovah
Ik werk met MRI, maar dit is wel wat vaagquote:
Hier lopen ook veel MRI mensen rond hè? Kennen jullie een voorbeeld waar je 1 type signaal registreerd en vervolgens naar een ander type signaal kijkt (lijkt me geen rare techniek) en hebben jullie een artikel waarin dat gebruikt wordt.
Mijn zoekterm opties raken een beetje op.
Kan je iets specifieker zeggen wat je zoekt?
Egregious professor of Cruel and Unusual Geography
Onikaan ni ov dovah
Onikaan ni ov dovah
Sorry je heb 2 signalen (in mijn geval ben ik een microscoopist dus 2 fluoforen rood en groen) nu registreer ik rood, ik draai de structuren zodat de rode signalen netjes op elkaar komen te liggen volgens vooropgelegde criterea. Vervolgens wil ik dan kijken naar de groene signalen die op dezelfde manier gedraaid zijn. Zeg maar registreren in 1 kanaal en beoordelen in het andere.quote:
[..]
Ik werk met MRI, maar dit is wel wat vaag
Hij lijkt mij een vrij eenvoudige techniek die wel vaker gebruikt moet worden maar kan het nog niet vinden.
En mochten we vallen dan is het omhoog. - Krang (uit: Pantani)
My favourite music is the music I haven't yet heard - John Cage
Water: ijskoud de hardste - Gehenna
My favourite music is the music I haven't yet heard - John Cage
Water: ijskoud de hardste - Gehenna
Ik werk ook in MRI maar ik snap 'em ook niet. Kan je het op een andere manier zeggen? Of een voorbeeld geven?quote:
Hier lopen ook veel MRI mensen rond hè? Kennen jullie een voorbeeld waar je 1 type signaal registreerd en vervolgens naar een ander type signaal kijkt (lijkt me geen rare techniek) en hebben jullie een artikel waarin dat gebruikt wordt.
Mijn zoekterm opties raken een beetje op.
Welke onderzoeksmethode moet ik gebruiken voor deskresearch?
Ik shuffel je woorden naar een hoogtepunt.
Sorry, zag deze niet. Nouja, je hebt bijvoorbeeld wel technieken waarbij je functionele informatie op structurele informatie registreert. Of waarbij je verschillende functionele scans over elkaar legt/vergelijkt. Bedoel je zoiets?quote:
[..]
Sorry je heb 2 signalen (in mijn geval ben ik een microscoopist dus 2 fluoforen rood en groen) nu registreer ik rood, ik draai de structuren zodat de rode signalen netjes op elkaar komen te liggen volgens vooropgelegde criterea. Vervolgens wil ik dan kijken naar de groene signalen die op dezelfde manier gedraaid zijn. Zeg maar registreren in 1 kanaal en beoordelen in het andere.
Hij lijkt mij een vrij eenvoudige techniek die wel vaker gebruikt moet worden maar kan het nog niet vinden.
Dat klinkt een beetje als de spatial registration die je bij MRI nodig hebt voor groepsanalyses. Wat je daarbij doet is een functionele scan maken waarbij het daadwerkelijke experiment gedaan wordt. Vervolgens meet je ook een hoog resolutie anatomische scan. Je doet dan eerst een rigide registratie van functionele data naar de anatomische scan, en vervolgens een non-rigide registratie van anatomische scan naar een common space template. Die twee transformaties samen zorgen dan dat je de functionele data in de common space hebt zitten, zodat bijvoorbeeld de visuele cortex van alle proefpersonen mooi overlappen.quote:
[..]
Sorry je heb 2 signalen (in mijn geval ben ik een microscoopist dus 2 fluoforen rood en groen) nu registreer ik rood, ik draai de structuren zodat de rode signalen netjes op elkaar komen te liggen volgens vooropgelegde criterea. Vervolgens wil ik dan kijken naar de groene signalen die op dezelfde manier gedraaid zijn. Zeg maar registreren in 1 kanaal en beoordelen in het andere.
Hij lijkt mij een vrij eenvoudige techniek die wel vaker gebruikt moet worden maar kan het nog niet vinden.
Egregious professor of Cruel and Unusual Geography
Onikaan ni ov dovah
Onikaan ni ov dovah
Mooi, ben niet de enige die daar aan moest denkenquote:
[..]
Sorry, zag deze niet. Nouja, je hebt bijvoorbeeld wel technieken waarbij je functionele informatie op structurele informatie registreert. Of waarbij je verschillende functionele scans over elkaar legt/vergelijkt. Bedoel je zoiets?
Egregious professor of Cruel and Unusual Geography
Onikaan ni ov dovah
Onikaan ni ov dovah
Bijna maar dan zonder die 2de registratie maar die 2de dataset gewoon volgens dezelfde parameters transformeren als je met die rigide registratie hebt gedaan.quote:
[..]
Dat klinkt een beetje als de spatial registration die je bij MRI nodig hebt voor groepsanalyses. Wat je daarbij doet is een functionele scan maken waarbij het daadwerkelijke experiment gedaan wordt. Vervolgens meet je ook een hoog resolutie anatomische scan. Je doet dan eerst een rigide registratie van functionele data naar de anatomische scan, en vervolgens een non-rigide registratie van anatomische scan naar een common space template. Die twee transformaties samen zorgen dan dat je de functionele data in de common space hebt zitten, zodat bijvoorbeeld de visuele cortex van alle proefpersonen mooi overlappen.
En mochten we vallen dan is het omhoog. - Krang (uit: Pantani)
My favourite music is the music I haven't yet heard - John Cage
Water: ijskoud de hardste - Gehenna
My favourite music is the music I haven't yet heard - John Cage
Water: ijskoud de hardste - Gehenna
Als de twee datasets voor de transformatie netjes overlappen kan je toch gewoon diezelfde transformatie ook op de tweede toepassen?quote:
[..]
Bijna maar dan zonder die 2de registratie maar die 2de dataset gewoon volgens dezelfde parameters transformeren als je met die rigide registratie hebt gedaan.
Egregious professor of Cruel and Unusual Geography
Onikaan ni ov dovah
Onikaan ni ov dovah
Plus, dat lijkt me ook belangrijk mbt het kijken naar groepsniveau.quote:
[..]
Als de twee datasets voor de transformatie netjes overlappen kan je toch gewoon diezelfde transformatie ook op de tweede toepassen?
het voorbeeld wat ik heb zijn dus 2 structuren die naar elkaar toe lijken te groeien. Zeg een groene slang en rode kubus, als ik nu alle slangen recht leg en zie dat in de tijd de kubussen steeds meer dicht bij de kop van de slang zitten kan ik dus zeggen in de tijd gaat de kop van de slang steeds meer naar de kubus toe.... (zoiets)quote:
[..]
Als de twee datasets voor de transformatie netjes overlappen kan je toch gewoon diezelfde transformatie ook op de tweede toepassen?
De kubussen wil je dus niet alignen
En mochten we vallen dan is het omhoog. - Krang (uit: Pantani)
My favourite music is the music I haven't yet heard - John Cage
Water: ijskoud de hardste - Gehenna
My favourite music is the music I haven't yet heard - John Cage
Water: ijskoud de hardste - Gehenna
I am so confused right nowquote:
[..]
het voorbeeld wat ik heb zijn dus 2 structuren die naar elkaar toe lijken te groeien. Zeg een groene slang en rode kubus, als ik nu alle slangen recht leg en zie dat in de tijd de kubussen steeds meer dicht bij de kop van de slang zitten kan ik dus zeggen in de tijd gaat de kop van de slang steeds meer naar de kubus toe.... (zoiets)
De kubussen wil je dus niet alignen
Als je aan de slangen gaat draaien kan je toch niet meer zeggen dat ze naar de kubussen groeien?
Egregious professor of Cruel and Unusual Geography
Onikaan ni ov dovah
Onikaan ni ov dovah
Ah zo... erh, misschien DTI? Waarbij je naar white matter structuur kijkt? Ik denk dat je zo met meerdere scans wel naar veranderingen over tijd kan kijken.quote:
[..]
het voorbeeld wat ik heb zijn dus 2 structuren die naar elkaar toe lijken te groeien. Zeg een groene slang en rode kubus, als ik nu alle slangen recht leg en zie dat in de tijd de kubussen steeds meer dicht bij de kop van de slang zitten kan ik dus zeggen in de tijd gaat de kop van de slang steeds meer naar de kubus toe.... (zoiets)
De kubussen wil je dus niet alignen
quote:
[..]
I am so confused right now
grafisch gezien, ik draai dus alleen aan de slangen... en zie nu aan de kubussen dat hij er naartoe kruipt in de tijd... (laten we zeggen ik zet het hoofd altijd rechts)
Ik doe dus niets met de kubbussen dat wil ik juist niet doen maar wel meedraaien met de slangen. De draai parameters haal ik puur uit de slangen, ik ben blind voor de kubussen...
en ik maar denken dat ik het wiel opnieuw aan het uitvinden was Prachtig mooie illustratie van mijn werk, wat doe je zoal
ik draai aan dingen die eruit zien als slangen Het is wel een vereenvoudigd model...[ Bericht 11% gewijzigd door Bosbeetle op 04-02-2015 16:53:25 ]
En mochten we vallen dan is het omhoog. - Krang (uit: Pantani)
My favourite music is the music I haven't yet heard - John Cage
Water: ijskoud de hardste - Gehenna
My favourite music is the music I haven't yet heard - John Cage
Water: ijskoud de hardste - Gehenna
Ja als de kubussen meedraaien met de slangen doe je dus iets met de kubussenquote:
[..]
[ afbeelding ]
grafisch gezien, ik draai dus alleen aan de slangen... en zie nu aan de kubussen dat hij er naartoe kruipt in de tijd... (laten we zeggen ik zet het hoofd altijd rechts)
Ik doe dus niets met de kubbussen dat wil ik juist niet doen maar wel meedraaien met de slangen.
Prachtig mooie illustratie van mijn werk, wat doe je zoal
Dat is wat ik bedoelde met dezelfde transformatie toepassen op beide datasets zodat de relatieve orientaties hetzelfde blijven.
Egregious professor of Cruel and Unusual Geography
Onikaan ni ov dovah
Onikaan ni ov dovah
Juist jaquote:
[..]
Ja als de kubussen meedraaien met de slangen doe je dus iets met de kubussen
Ik was verward door de term netjes overlappen ik werk met niet overlappende signalen, sorry voor mijn warrige omschrijving Zijn daar voorbeelden van
En mochten we vallen dan is het omhoog. - Krang (uit: Pantani)
My favourite music is the music I haven't yet heard - John Cage
Water: ijskoud de hardste - Gehenna
My favourite music is the music I haven't yet heard - John Cage
Water: ijskoud de hardste - Gehenna
De fMRI preprocessing pipeline is denk ik wel een goed voorbeeld. Alleen zorg je er dan eerst voor dat je twee datasets in dezelfde space terecht komen. Dat is bij jou al het geval.quote:
[..]
Juist ja
Zijn daar voorbeelden van
Misschien dat je hier wat bruikbare voorbeelden uit kan halen:
http://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fslcourse/lectures/reg.pdf
Egregious professor of Cruel and Unusual Geography
Onikaan ni ov dovah
Onikaan ni ov dovah
Kunnen we de op updaten en bosbeetles werkgebied draaien aan slangen noemen?
Op dinsdag 1 november 2016 00:05 schreef JanCees het volgende:
De polls worden ook in 9 van de 10 gevallen gepeild met een meerderheid democraten. Soms zelf +10% _O-
De polls worden ook in 9 van de 10 gevallen gepeild met een meerderheid democraten. Soms zelf +10% _O-
quote:Op woensdag 4 februari 2015 17:03 schreef oompaloompa het volgende:
Kunnen we de op updaten en bosbeetles werkgebied draaien aan slangen noemen?
Ik ben wel bioloog maar gelukkig gaat het niet over echte slangen dan was dit namelijk een erg raar onderzoek geweest, iedereen weet dat slangen blauwe kubussen prefereren.
En mochten we vallen dan is het omhoog. - Krang (uit: Pantani)
My favourite music is the music I haven't yet heard - John Cage
Water: ijskoud de hardste - Gehenna
My favourite music is the music I haven't yet heard - John Cage
Water: ijskoud de hardste - Gehenna
quote:
[..]
Ik ben wel bioloog maar gelukkig gaat het niet over echte slangen dan was dit namelijk een erg raar onderzoek geweest, iedereen weet dat slangen blauwe kubussen prefereren.
Op dinsdag 1 november 2016 00:05 schreef JanCees het volgende:
De polls worden ook in 9 van de 10 gevallen gepeild met een meerderheid democraten. Soms zelf +10% _O-
De polls worden ook in 9 van de 10 gevallen gepeild met een meerderheid democraten. Soms zelf +10% _O-
De een zit in DWDD over zijn slangen programma in Australie te kletsen, en de ander kijkt naar object preference in slangen!quote:
[..]
Ik ben wel bioloog maar gelukkig gaat het niet over echte slangen dan was dit namelijk een erg raar onderzoek geweest, iedereen weet dat slangen blauwe kubussen prefereren.
Ah daar heb ik zeker wat aan, ik heb alle algoritmes al wel lopen maar het is wel goed om een beetje terminologie te hebben, en misschien dat we dan kunnen refereren dat het in mri gebruikelijk is maar dat wij het toepassen op microscopiequote:
[..]
De fMRI preprocessing pipeline is denk ik wel een goed voorbeeld. Alleen zorg je er dan eerst voor dat je twee datasets in dezelfde space terecht komen. Dat is bij jou al het geval.
Misschien dat je hier wat bruikbare voorbeelden uit kan halen:
http://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fslcourse/lectures/reg.pdf
En mochten we vallen dan is het omhoog. - Krang (uit: Pantani)
My favourite music is the music I haven't yet heard - John Cage
Water: ijskoud de hardste - Gehenna
My favourite music is the music I haven't yet heard - John Cage
Water: ijskoud de hardste - Gehenna
Status wijziging vandaag naar 'Under Review', lijkt me goed..?quote:
Eergisteren ook mijn eerste manuscript gesubmit bij een Elsevier journal. De status was vanochtend nog 'With Editor', en nu staat ie op 'Decision in Process', volgens:
http://academia.stackexch(...)rial-system-ees-take
is dat al de laatste stap. Gaat dat echt zo snel..?
Ja, dat is goed.quote:
[..]
Status wijziging vandaag naar 'Under Review', lijkt me goed..?
Jesus saves but death prevails.
Ik zit al een week naar 'Reviews Completed' te kijken van de gereviseerde versie. Duurt lang!
Wij haalden opgelucht adem toen zij dat niet meer deden...
In de beeldverwerking heet dit inderdaad "registratie". Hoe ik het zou aanpakken: je registreert alle beelden met het groen-kanaal (de slangen) naar één beeld dat je hebt uitgekozen. De transformatie die uit elke registratie komt sla je op en pas je vervolgens toe op het rood-kanaal (de kubussen).quote:
[..]
[ afbeelding ]
grafisch gezien, ik draai dus alleen aan de slangen... en zie nu aan de kubussen dat hij er naartoe kruipt in de tijd... (laten we zeggen ik zet het hoofd altijd rechts)
Ik doe dus niets met de kubbussen dat wil ik juist niet doen maar wel meedraaien met de slangen. De draai parameters haal ik puur uit de slangen, ik ben blind voor de kubussen...
Prachtig mooie illustratie van mijn werk, wat doe je zoal
Vervolgens zou je een dichtheidsmaat kunnen uitrekenen, een 2D Gaussian fitten, whatever, om de "kubus-spreiding" te bepalen?
Registratie-tool: http://elastix.isi.uu.nl/ Werkt super goed. Is wel wat complex, maar je kunt er alles mee.
Schuimpje... mijn liefste. Verlaat mij nimmer weer...
Wij gebruiken imageJ en [url=http://bigwww.epfl.ch/thevenaz/stackreg/]stackreg[/url] om onze plaatjes te registreren. Geen idee of dat programma het ook toelaat om alleen slangen te registreren, en de kubussen ongemoeid te laten.
Good intentions and tender feelings may do credit to those who possess them, but they often lead to ineffective — or positively destructive — policies ... Kevin D. Williamson
Registreren ben ik bekend mee. Ik registreer niet naar een bekend object omdat ik geen idee heb hoe mij object er uit zou moeten zien, ik registreer naar eigenschappen en image featuresquote:Op vrijdag 6 februari 2015 17:42 schreef papernote het volgende:
[..]
In de beeldverwerking heet dit inderdaad "registratie". Hoe ik het zou aanpakken: je registreert alle beelden met het groen-kanaal (de slangen) naar één beeld dat je hebt uitgekozen. De transformatie die uit elke registratie komt sla je op en pas je vervolgens toe op het rood-kanaal (de kubussen).
Vervolgens zou je een dichtheidsmaat kunnen uitrekenen, een 2D Gaussian fitten, whatever, om de "kubus-spreiding" te bepalen?
Registratie-tool: http://elastix.isi.uu.nl/ Werkt super goed. Is wel wat complex, maar je kunt er alles mee.
Grappig genoeg is het niet moeilijk om dit soort tools te vinden maar lastiger om artikelen te vinden waar ze het gebruiken. De artikelen waarin ze de algoritmes voor registratie uit de doeken doen zijn er legio Thanks voor die link trouwens.
[ Bericht 1% gewijzigd door Bosbeetle op 09-02-2015 10:08:10 ]
En mochten we vallen dan is het omhoog. - Krang (uit: Pantani)
My favourite music is the music I haven't yet heard - John Cage
Water: ijskoud de hardste - Gehenna
My favourite music is the music I haven't yet heard - John Cage
Water: ijskoud de hardste - Gehenna
Het probleem met stackreg is dat je moeilijk je transformatie eruit kunt halen en op andere beelden kunt toepassen. (maar ik heb de registratie al lopen het gaat me nu meer om het correct in een artikel te zetten)quote:
Wij gebruiken imageJ en [url=http://bigwww.epfl.ch/thevenaz/stackreg/]stackreg[/url] om onze plaatjes te registreren. Geen idee of dat programma het ook toelaat om alleen slangen te registreren, en de kubussen ongemoeid te laten.
En mochten we vallen dan is het omhoog. - Krang (uit: Pantani)
My favourite music is the music I haven't yet heard - John Cage
Water: ijskoud de hardste - Gehenna
My favourite music is the music I haven't yet heard - John Cage
Water: ijskoud de hardste - Gehenna
Ik lees nu trouwens een boek over de geschiedenis van de optica echt super boeiend en grappig om wetenschap aan het werk te zien over zulke lange tijdspanne het boek heet from sight to light loopt van euclides tot en met kepler.
soms ziet iets heel ouds er vrij futuristisch uit
en grappig om wetenschap aan het werk te zien over zulke lange tijdspanne het boek heet from sight to light loopt van euclides tot en met kepler.
soms ziet iets heel ouds er vrij futuristisch uit
En mochten we vallen dan is het omhoog. - Krang (uit: Pantani)
My favourite music is the music I haven't yet heard - John Cage
Water: ijskoud de hardste - Gehenna
My favourite music is the music I haven't yet heard - John Cage
Water: ijskoud de hardste - Gehenna
Dat is nog eens ray tracen...
Optica is een machtig mooi vak, en Nederlanders spelen al eeuwen lang internationaal heel goed mee, met eerder Philips en nu ASML. In Delft zitten erg goede optici.
Optica is een machtig mooi vak, en Nederlanders spelen al eeuwen lang internationaal heel goed mee, met eerder Philips en nu ASML. In Delft zitten erg goede optici.
Good intentions and tender feelings may do credit to those who possess them, but they often lead to ineffective — or positively destructive — policies ... Kevin D. Williamson
