Het grote SARS-CoV-2 topic #478 Wir setzen uns mit Tranen nieder

quote:

Op zaterdag 28 maart 2020 03:19 schreef Nober het volgende:
Hoeveel ongeteste doden zijn er sinds 27/2 in Nederland?

Dat zullen we nooit weten, he?
Maar als ik al lees dat huisartsen 70+ers gaat bellen of ze nog wel op de ic willen als het zover is, dan denk ik dat de nee-zeggers er ook wel voor zullen verkiezen om gewoon thuis te blijven bij hun geliefden als ze toch sterven.

quote:

Op zaterdag 28 maart 2020 03:22 schreef Mammietje het volgende:

[..]

Dat zullen we nooit weten, he?
Maar als ik al lees dat huisartsen 70+ers gaat bellen of ze nog wel op de ic willen als het zover is, dan denk ik dat de nee-zeggers er ook wel voor zullen verkiezen om gewoon thuis te blijven bij hun geliefden als ze toch sterven.

Huisartsen die 70 plussers gaan bellen? Bedoel je dat ze die in het algemeen gaan bellen of de 70 plussers met klachten?

quote:

Op zaterdag 28 maart 2020 03:19 schreef Nober het volgende:
Hoeveel ongeteste doden zijn er sinds 27/2 in Nederland?

Ik heb het vermoeden dat dit er bij duitsland veel meer zijn.

quote:

Op zaterdag 28 maart 2020 02:52 schreef houdafstand het volgende:
Nederlands onderzoek:

twitter:

jankluytmans twitterde op vrijdag 27-03-2020 om 21:03:58 Most Healthcare Workers with #COVID-19 have mild disease and fever is reported in only half of the cases. Community acquisition is the most likely route in the vast majority.
SARS-CoV-2 infection in 86 healthcare workers in two Dutch hospitals https://t.co/JyVT0OkuN5 reageer retweet

[..]

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.03.23.20041913v1

En

twitter:

jankluytmans twitterde op zaterdag 28-03-2020 om 00:13:10 @:SMHopkins We sequenced the samples. No clusters related to the hospital at all. reageer retweet

Dit sluit wel aan op de bevindingen van IJsland, daar hebben ze steekproefsgewijs getest en de helft van de geteste mensen droeg het virus, zijn waren lang niet allemaal ziek (geweest).
Ik kan de bron niet vinden, neverMind, toch wel: https://english.alarabiya(...)ers-show-no-symptoms

quote:

Op zaterdag 28 maart 2020 03:31 schreef Markesh het volgende:

[..]

Huisartsen die 70 plussers gaan bellen? Bedoel je dat ze die in het algemeen gaan bellen of de 70 plussers met klachten?

80+ers met onderliggende klachten waren het. En (nog) niet overal, dat deden enkele posten.

Amsterdam gaat ook hard nu....

quote:

Op zaterdag 28 maart 2020 02:52 schreef houdafstand het volgende:
Nederlands onderzoek:

twitter:

jankluytmans twitterde op vrijdag 27-03-2020 om 21:03:58 Most Healthcare Workers with #COVID-19 have mild disease and fever is reported in only half of the cases. Community acquisition is the most likely route in the vast majority.
SARS-CoV-2 infection in 86 healthcare workers in two Dutch hospitals https://t.co/JyVT0OkuN5 reageer retweet

[..]

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.03.23.20041913v1

En

twitter:

jankluytmans twitterde op zaterdag 28-03-2020 om 00:13:10 @:SMHopkins We sequenced the samples. No clusters related to the hospital at all. reageer retweet

6.4% van de personen met symptomen, 0.89% van het personeel. In de periode 7-12 maart. Op 12 maart had Nederland 614 bevestigde gevallen.

Ik stel me daar toch een aantal vragen bij:
- als die 0.89% representatief is dan zouden er toen reeds meer dan 100.000 besmette personen in Nederland geweest zijn, wat wel erg veel lijkt.
- zijn er dan geen gevallen bij de patienten opgedoken?
- is het mogelijk dat er false positives bij zijn?

China meldde dat bij het close contact onderzoek heel wat false positives waren. Maar die studie is inmiddels retracted (zou handig zijn als ze ook de reden vermeldden)

quote:

When the infection rate of the close contacts and the sensitivity and specificity of reported results were taken as the point estimates, the positive predictive value of the active screening was only 19.67%, in contrast, the false-positive rate of positive results was 80.33%. The multivariate-probabilistic sensitivity analysis results supported the base-case findings, with a 75% probability for the false-positive rate of positive results over 47%. Conclusions: In the close contacts of COVID-19 patients, nearly half or even more of the 'asymptomatic infected individuals' reported in the active nucleic acid test screening might be false positives.

https://pubmed.ncbi.nlm.n(...)PcqNAtb9EzcQBKMtCIoI

Kunnen de samples gecontamineerd zijn? Dat was de suggestie bij close contact screening, dat thuis testen van gezinsleden van besmette personen false positives kan opleveren doordat het virus overal in de woning aanwezig is.
Al zou je bij false positives verwachten dat de cycle treshold values geen correlatie met het aantal dagen sinds de eerste symptomen vertonen.. (pagina 9)

- bij 2 personen was opname noodzakelijk. Dan zou je bij 150.000 gevallen 3500 opnames verwachten. Zou men die niet opgemerkt hebben?

[ Bericht 3% gewijzigd door crystal_meth op 28-03-2020 04:29:15 ]

quote:

Op zaterdag 28 maart 2020 04:18 schreef crystal_meth het volgende:
Kunnen de samples gecontamineerd zijn? Dat was de suggestie bij close contact screening, dat thuis testen van gezinsleden van besmette personen false positives kan opleveren doordat het virus overal in de woning aanwezig is.
Al zou je bij false positives verwachten dat de cycle treshold values geen correlatie met het aantal dagen sinds de eerste symptomen vertonen.. (pagina 9)

- bij 2 personen was opname noodzakelijk. Dan zou je bij 150.000 gevallen 3500 opnames verwachten. Zou men die niet opgemerkt hebben?

Gezien hoe besmettelijk dit virus is, is het vrij aannemelijk dat wanneer 1 in een gezin is besmet, het hele gezin mag geworden gezien als besmet.

quote:

Op zaterdag 28 maart 2020 06:24 schreef Nielsch het volgende:
Waarom staan landen als de VS en Brazilië niet op onze no-fly lijst?

economie FTW !!!

quote:

Op zaterdag 28 maart 2020 06:31 schreef Nielsch het volgende:
Nu zullen al die vluchten uit de VS met name Nederlanders zijn die terug willen. Hoop wel dat met name die uit New York in quarantaine moeten. Zal wel weer niet...

nog steeds slappe hap regels in NL......

quote:

Op zaterdag 28 maart 2020 06:24 schreef Nielsch het volgende:
Waarom staan landen als de VS en Brazilië niet op onze no-fly lijst?

Alle vluchten buiten het Schengen gebied worden toch geweerd tenzij cargo en repatriëring?

gewoon community spread met/tussen kinderen en volwassenen:

A two-year-old child and a childcare worker at the same Sydney childcare centre have tested positive for Covid-19, as has a three-year old child who was a household contact of someone who contracted the disease overseas.

maar in nederland lekker buiten spelen !!

quote:

Op zaterdag 28 maart 2020 00:59 schreef Isabeau het volgende:

. Misschien moeten we die maatregelen er maar gewoon in houden

Mijn handen zien er inmiddels uit als een risicogroep dus ik hou gewoon liever de 1,5 meter er in, vooral rond oud en nieuw.

quote:

Op zaterdag 28 maart 2020 04:52 schreef Elizium het volgende:

[..]

Gezien hoe besmettelijk dit virus is, is het vrij aannemelijk dat wanneer 1 in een gezin is besmet, het hele gezin mag geworden gezien als besmet.

Dat zou je verwachten, ja, maar volgens die (retracted) studie was dat dus niet zo.

Misschien is de studie teruggetrokken omdat de gegevens niet klopten, maar volgens mij hebben ze een verkeerde formule (of definitie) gebruikt:

quote:

positive predictive value of the active screening was only 19.67%
the false-positive rate of positive results was 80.33%.

de som is exact 100%, wat wel erg toevallig zou zijn, want het complement van de PPV is de FDR (false discovery rate), niet de FPR (false positive rate).

SPOILER

Om spoilers te kunnen lezen moet je zijn ingelogd. Je moet je daarvoor eerst gratis Registreren. Ook kun je spoilers niet lezen als je een ban hebt.

Misschien dat het daarom retracted was, omdat ze een foute benaming of formule gebruikten. Maar dat betekent niet dat de gegevens waarop ze zich baseerden fout waren. Als ze geen hoog aantal false positives hadden opgemerkt zouden ze de paper niet geschreven hebben...

quote:

Op zaterdag 28 maart 2020 06:31 schreef Nielsch het volgende:
Nu zullen al die vluchten uit de VS met name Nederlanders zijn die terug willen. Hoop wel dat met name die uit New York in quarantaine moeten. Zal wel weer niet...

Ik vrees ook van niet. Er zal eens daadkrachtig worden opgetreden...

quote:

Op zaterdag 28 maart 2020 07:01 schreef crystal_meth het volgende:

[..]

Dat zou je verwachten, ja, maar volgens die (retracted) studie was dat dus niet zo.

Misschien is de studie teruggetrokken omdat de gegevens niet klopten, maar volgens mij hebben ze een verkeerde formule (of definitie) gebruikt:
[..]

de som is exact 100%, wat wel erg toevallig zou zijn, want het complement van de PPV is de FDR (false discovery rate), niet de FPR (false positive rate).

SPOILER

Om spoilers te kunnen lezen moet je zijn ingelogd. Je moet je daarvoor eerst gratis Registreren. Ook kun je spoilers niet lezen als je een ban hebt.

Misschien dat het daarom retracted was, omdat ze een foute benaming of formule gebruikten. Maar dat betekent niet dat de gegevens waarop ze zich baseerden fout waren. Als ze geen hoog aantal false positives hadden opgemerkt zouden ze de paper niet geschreven hebben...

Als alleen een berekening fout is maar de conclusies kloppen en de rest ook dan hadden ze wel een corrigendum kunnen doen.

quote:

Op zaterdag 28 maart 2020 06:31 schreef Nielsch het volgende:
Nu zullen al die vluchten uit de VS met name Nederlanders zijn die terug willen. Hoop wel dat met name die uit New York in quarantaine moeten. Zal wel weer niet...

Heeft ook weinig nut. NY heeft nu 40.000 besmettingen, Nederland 8000. Dan is de kans dat ze besmet zijn pakweg 10 keer hoger dan die van de gemiddelde Nederlander. Het kleine aantal dat terugkomt is dan verwaarloosbaar tov de 17 miljoen die hier zijn, het volstaat dat ze zich aan dezelfde regels houden als de rest van de bevolking.
(en dat in de veronderstelling dat er in NYeven weinig getest wordt als hier)

The sensitivity of throat swab was 71.32% and 92.19% at first to second PCR test. Among different modes of contact, household contacts were the most dangerous in catching with infection of COVID-19, with an incidence of 10.2%. As the increase of age for close contacts and severity of source cases, the incidence of COVID-19 presented an increasing trend from 1.8% (0-17 years) to 4.2% (60 or over years), and from 0.33% for asymptomatic, 3.3% for mild, to 6.2% for severe and critical source cases, respectively. Manifestation of expectoration in source cases was also highly associated with an increased risk of infection in their close contacts (13.6%). Secondary cases were in general clinically milder and were less likely to have common symptoms than those of source cases. Conclusions In conclusion, the proportion of asymptomatic and mild infections account for almost half of the confirmed cases among close contacts. The household contacts were the main transmission mode, and clinically more severe cases were more likely to pass the infection to their close contacts. Generally, the secondary cases were clinically milder than those of source cases.

bron

Pre-print!

Zoals ik het lees is "thuis" de grootste besmettingsbron, waarmee de besmettingen dus ook nog even doorlopen, ook na een lockdown.

Maar bij het doorgeven van de ziekte binnen het gezin, zijn de opvolgende besmettingen wel minder heftig. Misschien reageert je lichaam sneller op virussen vanuit een gezinslid, waardoor je minder klachten hebt. Wilde gok, maar fascinerend is het wel.

quote:

Op zaterdag 28 maart 2020 06:31 schreef Nielsch het volgende:
Nu zullen al die vluchten uit de VS met name Nederlanders zijn die terug willen. Hoop wel dat met name die uit New York in quarantaine moeten. Zal wel weer niet...

Ik mag het toch hopen, anders hebben we over een paar weken weer een hoop nieuwe besmettingen erbij, terwijl er qua IC een nachtmerrie aan komt.
Maar ik sta er hier in Nederland niet eens van te kijken als zij bij thuiskomst niet in quarantaine hoeven.
Of hooguit in vrijwillige thuisquarantaine, waar een deel zich dan vast weer niet aan zal gaan houden.

quote:

Op zaterdag 28 maart 2020 07:15 schreef Fer_de_Lance het volgende:
[ afbeelding ]

[ afbeelding ]

AD

De eerste al op 19 februari.

En dan ook nog eens geen ziekenhuisclusters, dus het ging toen al lekker rond. Tssk. Terwijl men wist dat dit een groot effect zou gaan hebben op zorgmedewerkers, want dit was ook al zo in China (en Italie). Waarom niet toen al uitgebreid testen in de zorg.

Byegons.

quote:

Op zaterdag 28 maart 2020 07:26 schreef Fer_de_Lance het volgende:

[..]

merkwaardig is het, ik bedoel elke besmetting na die eerste Chinees is minimaal secundair geweest lijkt me... dus het ligt of aan het feit dat het idd van een gezinslid komt, of misschien de graduele blootstelling?

opmerkelijk

Secundair binnen het gezin. Sorry, slordig.

Ja, vreemd he. Op zich wel positief voor gezinnen die samen in quarantaine zitten met 1 ziek familielid.

quote:

Op zaterdag 28 maart 2020 07:26 schreef Fer_de_Lance het volgende:
al klinkt het als ik zo teruglees wel een beetje als een mengele experiment

Die naam spookt al weken door mijn hoofd. Das experiment.

quote:

Op zaterdag 28 maart 2020 07:26 schreef Fer_de_Lance het volgende:

.

al klinkt het als ik zo teruglees wel een beetje als een mengele experiment

Ik denk dat Rutte en van Dissel wel in jouw kamp gaan zitten om dit ten uitvoer te brengen.
Maar ja, interessant idd.