Het Ribosoom :)

Nobelprijs van dit jaar voor de scheikunde gaat naar "het ribosoom" De winnaars hebben bij gedragen aan het omschrijven van de functie en structuur van het ribosoom.

Daarom is het tijd voor topic over het ribosoom. Misschien is het sowieso leuk om in W&T wat meer beschrijvende topics te creeëren het hoeft niet altijd over een probleem te gaan of over een vrij recente ontdekking maar soms kan het ook over bijvoorbeeld een celorganel of een bepaalde functie etc. etc. gaan. Het leek mij leuk om daar eens over te beginnen het hoeft niet gelijk tekstboek werk te worden maar het kan meer een speelse doch leuke manier zijn om geintroduceerd te worden in bepaalde stukjes van de wetenschap.

Nu dan het ribosoom


Wat is er zo bijzonder aan het ribosoom. Nou het is het eiwit/RNA complex dat zorgt voor de translatie van RNA. Het leest dus mRNA en zet dit om naar eiwit. Een hele basale functie in alle biologische systemen. Het 2de pijltje in het centrale dogma DNA -> RNA -> eiwit dit pijltje zou niet bestaan als het ribosoom er niet was. Sterker nog het ribosoom zou nooit ontdekt zijn als men nooit had begrepen dat DNA en eiwitten gelinked waren.

In het heel kort Ribosomen lezen codons in het RNA af (3 baseparen per keer) elke 3 baseparen staan voor 1 aminozuur het ribosoom leest dit en combineert het aan tRNA gekoppelde aminozuur aan het volgende aminozuur. Het leest RNA af en gebruikt voor het aflezen ook RNA hier ligt het door watson en crick ontdekte paarswijs systeem dat er voor zorgt dat dit kan. Dit maakt het ribosoom erg bijzonder omdat de werkzame eenheid dus een eiwit/RNA complex van enorme grootte.

Dit is een klein stukje basis er zijn vast mensen die iets toe willen/kunnen voegen. Of er zijn vast vragen te over.

Ik zou zeggen doe een beetje leuk mee en stap met zn allen binnen in de wereld van het ribosoom, 50S 30S subunits, wobble pairing, translatie, RER etc...

Maak van dit topic iets waarvan mensen later denken er was toch zo'n topic over zo'n eiwit oid dat wil ik nog wel eens terug lezen.

op een heel andere noot, even een klassieker : vinden jullie wobbelpairing ook irritant

quote:

Op maandag 7 oktober 2009 14:40 schreef Metalfrost het volgende:

[..]

klassieker*

patato tomato allebei uit hetzelde genus

quote:

Op maandag 7 oktober 2009 14:41 schreef Dibble het volgende:
Ik snap d'r echt niks van

DNA --> RNA --> Eiwit

Nou vast wel eens van dat eerste DNA gehoord daarin ligt onze erfelijk materiaal opgeslagen. Op ons erfelijk materiaal staat welke eiwitten hoe gebouwd moeten worden maar ons DNA is erg stabiel dus daar kun je eigenlijk niet zo veel mee doen. Dus is er een wat instabielere vorm nodig dat is RNA. DNA wordt afgelezen en omgezet in RNA. Dat RNA wordt weer afgelezen door een ribosoom en die maakt er Eiwit van. Die eiwitten zijn datgene dat ons maken wat we zijn die hebben functie en structuur en DNA niet (RNA in minder mate maar dat is een detail)

Nou zijn er 4 basen waar DNA en RNA uit bestaan. Maar er zijn 21 aminozuren bouwstenen van eiwitten. Je kunt dus niet rechtstreeks RNA vertalen door te zeggen base G is aminozuur D er is een code voor nodig. Die code bestaat uit reeksjes van 3 basen elke verschillende reeks geeft een andere aminozuur aan.



wat het ribosoom dus doet is deze codon lezen en vertalen naar eiwit. Het ribosoom leest ACA en zorgt er dan voor dat er een threonine aan het eiwit gezet wordt.

ohja zo ziet een stukje ervan eruit


70S

30S
In een cartoon dus hè

hier zien we ze in een cel op het ER



en hier op RNA loops waar ze niet meer vanaf kunnen



Het zijn dus die zwarte bolletjes

quote:

Op maandag 7 oktober 2009 16:01 schreef Metalfrost het volgende:
[ afbeelding ]

Zowel kaas, tomaat, pasta, peper en spekjes zouden niet bestaan zonder het ribosoom

quote:

Op maandag 7 oktober 2009 16:16 schreef Metalfrost het volgende:

[..]

Het zal wel, de meeste groenten groeien uit de grond dmv zaden, irrigatie en goede landbouw, daar hebben we geen wetenschap voor nodig.

waarom zijn irrigatie en goede landbouw geen wetenschap? Oude wetenschap maar toch zeker wel wetenschap. Als er geen inventieve boeren waren geweest hadden we nu nogsteeds ons eten moeten zoeken.

quote:

Op zaterdag 10 oktober 2009 01:23 schreef kless het volgende:
Tof eiwit complex zo een ribosoom (zitten er ook cofactoren in?) wat RNA code "weet"? en er prima eiwitjes mee bouwt.

Hoe komt het eigenlijk van die "codon usage" is dat een verschil in tRNA's of ligt dat aan de ribosomen.

Soms is het wel even een 'OEPS' moment als je de RBS in je constucten vergeten bent.
Zoals bijvoorbeeld in het project in mijn iGEM project

Co-factoren weet ik niet. Maar de herkenning van RNA code loopt geheel via de tRNAs en daar heb je ook het antwoord op je 2de vraag, sommige organismen hebben niet even veel tRNAs van alle codons. Er is een verschil in codon gebruik tussen planten, dieren en bacterien. Voor het maken van transgene eiwitten hebben ze daarom bacteri"en gemaakt die ook efficient zijn voor dierlijke tRNAs. Dit verschjnsel wordt soms ook gebruikt voor quality control als een ribosoom erg lang doet over een gen als er een bepaalde mutatie in zit kan dit voor timing zorgen en soms voor afbraak of premature terminatie.

quote:

Op zaterdag 10 oktober 2009 12:21 schreef Cynic het volgende:

[..]

Jezus, het is ook niet gek dat we uiteindelijk allemaal doodgaan met dat soort rommel in ons lichaam!

en dat is er nog maar 1tje er zitten er honderden van in elke cel in je lijf