abonnement Unibet Coolblue
pi_150201497
quote:
14s.gif Op maandag 2 maart 2015 00:03 schreef Rezania het volgende:

[..]

Dit ja. Iets begrijpen, ook al is het 'maar' een biologisch systeem, kost wel iets meer moeite dan snel een samenvatting doorlezen. Om cellen goed te kunnen modelleren heb je inzicht nodig in celbiologie, biochemie en biofysica om maar wat te noemen. Dat is heel wat anders dan leren dat een boom hout- en bastvaten heeft en een koei 4 poten om maar wat te noemen.
Vooropgesteld dat allicht nog niet alle details bekend zijn, hoe ingewikkeld is het om een mentaal overzicht te vormen als je voor alle componenten leest hoe ze werken. Ik neem dan maar even aan dat iemand die een wiskundige opleiding aankan snel en gemakkelijk begrippen zoals diffusie, osmose, na/ka-pomp, het belang van ionen in kanalen, eiwittranslatie, de invloed van ladingen op het vouwen van eiwitten, de principes van enzymen, het knippen en plakken van stukken DNA etc. begrijpt om maar wat elementaire voorbeeldjes te noemen. Ik begrijp jouw punt hoor, je moet allerlei kennis paraat hebben om het totaalplaatje te overzien.
ING en ABN investeerden honderden miljoenen euro in DAPL.
#NoDAPL
pi_150201984
quote:
0s.gif Op maandag 2 maart 2015 00:10 schreef Bram_van_Loon het volgende:

[..]

Vooropgesteld dat allicht nog niet alle details bekend zijn, hoe ingewikkeld is het om een mentaal overzicht te vormen als je voor alle componenten leest hoe ze werken. Ik neem dan maar even aan dat iemand die een wiskundige opleiding aankan snel en gemakkelijk begrippen zoals diffusie, osmose, na/ka-pomp, het belang van ionen in kanalen, eiwittranslatie, de invloed van ladingen op het vouwen van eiwitten, de principes van enzymen, het knippen en plakken van stukken DNA etc. begrijpt om maar wat elementaire voorbeeldjes te noemen. Ik begrijp jouw punt hoor, je moet allerlei kennis paraat hebben om het totaalplaatje te overzien.
Dan heb je een model waarvan alles al staat beschreven en maar een enkele vorm heeft. Daar heb je dus niks aan. Het voordeel van modelleren is juist dat je situaties kan simuleren aan de hand van bekende situatie. En je gaat mij niet vertellen dat jij kan voorspellen hoe iets zal werken onder andere omstandigheden als jou het inzicht ontbreekt over hoe iets nou precies werkt; signalen, kinetiek, thermodynamica, vouwing, kwantummechanica, alles.

De werking van enzymen bijvoorbeeld. Jij denkt dan "Een enzym verlaagt de activeringsenergie van een reactie." Dat klopt, maar dat is dr meest basale vorm. Maak daar een model van en je hebt er niks aan, echt niks. Ik wil juist weten hoe een enzym precies werkt, overal waardes aan toekennen. Dan pas kan ik vervolgens met een wiskundig model voorspellen hoe het zich gaat gedragen onder andere omstandigheden of hoe ik de omstandigheden voor dat enzym kan optimaliseren. Wederom heb je daar inzicht voor nodig. een model toepassen van een gewoon enzym op een enzym dat moet binden aan een ligand voor een conformatieverandering voordat het werkt gaat niet. Daar heb je precies dat inzicht voor nodig, niet enkel kennis, anders ga je zwaar de fout in.
Gist is liefde, gist is leven. Vooral in een vagijn.
pi_150202008
Dat was trouwens veel te lang om te typen met een mobiel. :')
Gist is liefde, gist is leven. Vooral in een vagijn.
pi_150202060
quote:
1s.gif Op maandag 2 maart 2015 00:29 schreef Rezania het volgende:

[..]

Dan heb je een model waarvan alles al staat beschreven en maar een enkele vorm heeft. Daar heb je dus niks aan. Het voordeel van modelleren is juist dat je situaties kan simuleren aan de hand van bekende situatie. En je gaat mij niet vertellen dat jij kan voorspellen hoe iets zal werken onder andere omstandigheden als jou het inzicht ontbreekt over hoe iets nou precies werkt; signalen, kinetiek, thermodynamica, vouwing, kwantummechanica, alles.

De werking van enzymen bijvoorbeeld. Jij denkt dan "Een enzym verlaagt de activeringsenergie van een reactie." Dat klopt, maar dat is dr meest basale vorm. Maak daar een model van en je hebt er niks aan, echt niks. Ik wil juist weten hoe een enzym precies werkt, overal waardes aan toekennen. Dan pas kan ik vervolgens met een wiskundig model voorspellen hoe het zich gaat gedragen onder andere omstandigheden of hoe ik de omstandigheden voor dat enzym kan optimaliseren. Wederom heb je daar inzicht voor nodig. een model toepassen van een gewoon enzym op een enzym dat moet binden aan een ligand voor een conformatieverandering voordat het werkt gaat niet. Daar heb je precies dat inzicht voor nodig, niet enkel kennis, anders ga je zwaar de fout in.
Fair enough. Je komt dan echter eerder op een combi van wiskunde, informatica, chemie en natuurkunde terecht met wat elementaire biologie dan op een combi van wiskunde, informatica en biologie, nietwaar?
ING en ABN investeerden honderden miljoenen euro in DAPL.
#NoDAPL
pi_150202684
quote:
0s.gif Op zondag 1 maart 2015 21:51 schreef netchip het volgende:
Bestaan er eigenlijk minors gefocust op mathematische biologie? Ik kwam namelijk dit, dit, en dit tegen. Dit wekte mijn interesse, maar ik vraag me af welke studies het beste bij dit soort onderwerpen passen?
Deze bijvoorbeeld?

https://ssc.wur.nl/Rooster/MinorProgramma/WUSYB

Welke studie daar het beste bij past? Ik denk biologie en anders wiskunde. Systeembiologie heb je op cellulair niveau, maar kun je ook proberen toe te passen op ecologisch niveau.
Als je het op moleculair niveau toepast heet het al fysische chemie.
Natuurlijk wel interessant om de relevante cellulaire processen/metabolic pathways te vangen in differentiaalvergelijking/ en/of linieare algebra als het gaat over bijv een bacterie die medicijnen produceert of over kanker- of hersencellen.

Bioinformatica is nu nog meer genetisch, maar ik denk dat dat gaat veranderen de komende 20 jaar. Nu is het vooral databases met genomen en zoekalgoritmes enzo.
Waar je nu in Nederland al hele opleidingen bioinformatica hebt heb je op sommige plekken in de wereld ook MSc'en met als track systems biology.

Biologie is simpel? Tuurlijk. Is ook waarom de snelste supercomputers met biologische vraagstukken bezig zijn, zoals eiwitvouwing.

En er is ook nog eens zo iets als dingen uit je hoofd leren. Ja, buiten de wis- en natuurkunde doet men daar nog aan.
http://www.cc.gatech.edu/(...)tabolic_pathways.png

Maar als het ingewikkeld wordt dan zal Bram het wel weer geen biologie meer vinden. Of, omdat het om alleen eerstegraads benaderingen gaat, omdat het voor meer detail nu nog te complex is, zal de wiskunde die je er voor nodig hebt wel te basaal zijn.

Biologie nu is wat scheikunde 40 jaar geleden was. Daarom winnen ook elke keer biologen zowel de nobelprijs voor de chemie als voor de fysiologie&geneeskunde.
Scheikundigen houden zich nu bezig met natuurkunde. Is niet voor niets dat natuurkundigen zelf in een crisis zitten. Theoretische natuurkunde lijkt om een dood spoor te zitten, en de experimentalisten hebben apparatuur van miljarden nodig.


Tja, je kunt net zo goed zeggen dat een wiskundeboek 4x minder tekst heeft, en dat je dat na 1 keer lezen ook snapt.
Ik doe zelf een biochemie-opleiding en ik merk juist dat ik de biologie altijd onderschat. Met wis of scheikunde is het zo makkelijk om precies te weten hoe je iets onder de knie krijgt.
En dat zeg ik als geheugenwonder.

En daarvan los nog staande de labskills die je nodig hebt om als wetenschapper in de moleculaire&cellbiologie/biochemie iets klaar te spelen. Dat haal je niet uit een boekje.

[ Bericht 3% gewijzigd door Pandarus op 02-03-2015 01:24:13 ]
pi_150205393
quote:
0s.gif Op maandag 2 maart 2015 00:33 schreef Bram_van_Loon het volgende:

[..]

Fair enough. Je komt dan echter eerder op een combi van wiskunde, informatica, chemie en natuurkunde terecht met wat elementaire biologie dan op een combi van wiskunde, informatica en biologie, nietwaar?
Zo kan je alles wel onder de noemer natuurkunde schuiven. :')
Gist is liefde, gist is leven. Vooral in een vagijn.
pi_150211679
Ik werd net aangesproken door een IO'er, blijkbaar mag ik niet fucken met Jezus want dat beledig je God. :') Wist niet dat er zulke religieuze figuren rondliepen op de TU.
Gist is liefde, gist is leven. Vooral in een vagijn.
pi_150218681
quote:
10s.gif Op maandag 2 maart 2015 09:09 schreef Rezania het volgende:

[..]

Zo kan je alles wel onder de noemer natuurkunde schuiven. :')
Natuurkunde en chemie. Tja, de bouwsteentjes die jij noemde vallen onder deze vakgebieden: quantummechanica, thermodynamica, kinetiek.
ING en ABN investeerden honderden miljoenen euro in DAPL.
#NoDAPL
pi_150218756
quote:
1s.gif Op maandag 2 maart 2015 13:07 schreef Rezania het volgende:
Ik werd net aangesproken door een IO'er, blijkbaar mag ik niet fucken met Jezus want dat beledig je God. :') Wist niet dat er zulke religieuze figuren rondliepen op de TU.
Mijn TU heeft/had zelfs een 'stilteruimte' waar moslims kunnen bidden. :{
ING en ABN investeerden honderden miljoenen euro in DAPL.
#NoDAPL
pi_150219245
quote:
0s.gif Op maandag 2 maart 2015 01:17 schreef Pandarus het volgende:
Biologie is simpel? Tuurlijk. Is ook waarom de snelste supercomputers met biologische vraagstukken bezig zijn, zoals eiwitvouwing.
Complexiteit is juist mogelijk dankzij eenvoud. Juist omdat legosteentjes (of bakstenen voor volwassenen :)) op zichzelf eenvoudig zijn kan je de meest uiteenlopende en eventueel complexe constructies maken, juist omdat logische schakelelementen op ziczhzelf eenvoudig zijn kan je complexe rekennetwerken maken, juist omdat neuronen op zichzelf eenvoudig zijn kan je complexe hersenen krijgen, juist omdat aminozuren op ziczhelf eenvoudig zijn kan je de meest uiteenlopende eiwitten bouwen, juist omdat DNA-moleculen op zichzelf eenvoudig zijn (4 elementjes die twee paren vormen) kan je heel de genetische code hiermee maken. Eenvoud leidt tot complexiteit. Alleen is de complexiteit op een gegeven moment zo hoog dat een mens het niet kan bijbenen en dat hij computers moet inschakelen, de mens moet dan proberen om de basisprincipes goed te begrijpen zodat met die basisprincipes een computer het zware rekenwerk kan doen. Hoe dan ook moet je een balans zoeken tussen een aantal vakgebieden als je zoiets wil doen, daar zullen we het met zijn allen wel over eens zijn, de vraag is welke verhouding je nodig hebt.

quote:
Maar als het ingewikkeld wordt dan zal Bram het wel weer geen biologie meer vinden. Of, omdat het om alleen eerstegraads benaderingen gaat, omdat het voor meer detail nu nog te complex is, zal de wiskunde die je er voor nodig hebt wel te basaal zijn.
Nee en nee.
ING en ABN investeerden honderden miljoenen euro in DAPL.
#NoDAPL
pi_150219836
Snap weinig van je post, vooral taalkundig gezien.

Ja, ook in de biologie heb je simpele en complexe dingen. DNA code is een voorbeeld van een simpel vraagstuk. Iedereen kan met een tabel basenparen omzetten in aminozuren. Maar niemand kan van een aminozuursequentie zomaar naar een 3d structuur.

En naast de genetische code is er ook nog de epigenetische code, en die is zo complex dat deze als code bijna niet te herkennen is.

Snap ook niet waarom een aminozuur simpel is. Zijn zat moleculen die simpeler zijn.

DNA bestaat trouwens niet uit alleen de nucleobasen. Weet niet of dit luiheid of gewoon gebrek aan gevoel voor wat belangrijk is is, dat je dat wel zo durft te stellen. Denk dat laatste.
De rest van het DNA-molecul draagt net zo veel bij aan de verklaringskracht van het hele model.

[ Bericht 11% gewijzigd door Pandarus op 02-03-2015 17:05:42 ]
pi_150220155
Jongens, kap deze discussie maar want Bram vindt toch alles wat geen wiskunde is simpel en niet de moeite waard.
  maandag 2 maart 2015 @ 17:08:02 #38
122648 Bravebart
København er på plads ja
pi_150220242
quote:
0s.gif Op maandag 2 maart 2015 17:05 schreef Mitsu het volgende:
Jongens, kap deze discussie maar want Bram vindt toch alles wat geen wiskunde is simpel en niet de moeite waard.
Ik was ook al uitgetuned ja :')
Op donderdag 22 november 2012 00:14 schreef ondeugend het volgende:
liefdevolle gevoelens voor de duisternis
pi_150220311
quote:
0s.gif Op maandag 2 maart 2015 17:05 schreef Mitsu het volgende:
Jongens, kap deze discussie maar want Bram vindt toch alles wat geen wiskunde is simpel en niet de moeite waard.
Ik denk dat Bram bedoelt dat een vak als Biochemie makkelijker voor een wiskundige is, dan een vak als Complexe Analyse of Topologie voor een bioloog. Geen idee of het waar is.
pi_150220487
quote:
0s.gif Op maandag 2 maart 2015 17:05 schreef Mitsu het volgende:
Jongens, kap deze discussie maar want Bram vindt toch alles wat geen wiskunde is simpel en niet de moeite waard.
Niet gelezen maar eens met Bram.
pi_150220529
quote:
0s.gif Op maandag 2 maart 2015 17:05 schreef Mitsu het volgende:
Jongens, kap deze discussie maar want Bram vindt toch alles wat geen wiskunde is simpel en niet de moeite waard.
Je kunt zijn post reporten.
pi_150220636
EXA _O_
quote:
0s.gif Op maandag 2 maart 2015 17:16 schreef Pandarus het volgende:

[..]

Je kunt zijn post reporten.
nou nou nou :{
  maandag 2 maart 2015 @ 17:18:29 #43
122648 Bravebart
København er på plads ja
pi_150220646
quote:
0s.gif Op maandag 2 maart 2015 17:16 schreef Pandarus het volgende:

[..]

Je kunt zijn post reporten.
Lol :')
Op donderdag 22 november 2012 00:14 schreef ondeugend het volgende:
liefdevolle gevoelens voor de duisternis
pi_150220879
Als je vindt dat discussie geen nut heeft en dat dat aan die user ligt, is dat het logische vervolg.

Raar dat je anderen oproept te stoppen met reageren op uitspraken van een ander.

[ Bericht 16% gewijzigd door Pandarus op 02-03-2015 17:28:58 ]
pi_150221029
quote:
0s.gif Op maandag 2 maart 2015 17:16 schreef Pandarus het volgende:

[..]

Je kunt zijn post reporten.
_O- _O-
pi_150221965
quote:
0s.gif Op maandag 2 maart 2015 01:17 schreef Pandarus het volgende:

[..]

Deze bijvoorbeeld?

https://ssc.wur.nl/Rooster/MinorProgramma/WUSYB

Welke studie daar het beste bij past? Ik denk biologie en anders wiskunde. Systeembiologie heb je op cellulair niveau, maar kun je ook proberen toe te passen op ecologisch niveau.
Als je het op moleculair niveau toepast heet het al fysische chemie.
Zoiets, ja, maar dan gerichter op wiskunde. Ik vind programmeren erg leuk, maar ik wil geen informatica studeren. De theorie erachter maakt me eigenlijk niet zoveel uit, en die kennis ga je ook nooit gebruiken buiten de informatica.
quote:
Natuurlijk wel interessant om de relevante cellulaire processen/metabolic pathways te vangen in differentiaalvergelijking/ en/of linieare algebra als het gaat over bijv een bacterie die medicijnen produceert of over kanker- of hersencellen.
Dat kan een LST'er ook wel, bijvoorbeeld. Kijk eens naar de mathematische fysica, dat is een tak van de natuurkunde die steeds meer leunt op de wiskunde waarvan eerst werd gezegd dat het nutteloos is: de algebra en de topologie.
quote:
Bioinformatica is nu nog meer genetisch, maar ik denk dat dat gaat veranderen de komende 20 jaar. Nu is het vooral databases met genomen en zoekalgoritmes enzo.
Waar je nu in Nederland al hele opleidingen bioinformatica hebt heb je op sommige plekken in de wereld ook MSc'en met als track systems biology.

Biologie is simpel? Tuurlijk. Is ook waarom de snelste supercomputers met biologische vraagstukken bezig zijn, zoals eiwitvouwing.

En er is ook nog eens zo iets als dingen uit je hoofd leren. Ja, buiten de wis- en natuurkunde doet men daar nog aan.
http://www.cc.gatech.edu/(...)tabolic_pathways.png

Maar als het ingewikkeld wordt dan zal Bram het wel weer geen biologie meer vinden. Of, omdat het om alleen eerstegraads benaderingen gaat, omdat het voor meer detail nu nog te complex is, zal de wiskunde die je er voor nodig hebt wel te basaal zijn.

Biologie nu is wat scheikunde 40 jaar geleden was. Daarom winnen ook elke keer biologen zowel de nobelprijs voor de chemie als voor de fysiologie&geneeskunde.
Scheikundigen houden zich nu bezig met natuurkunde. Is niet voor niets dat natuurkundigen zelf in een crisis zitten. Theoretische natuurkunde lijkt om een dood spoor te zitten, en de experimentalisten hebben apparatuur van miljarden nodig.
De mathematische fysica (snaartheorie, loop quantum gravity) is juist veelbelovend. Met die machines van tientallen miljarden kunnen we wel het universum verklaren, uiteindelijk. Vanaf het begin tot nu.
quote:
Tja, je kunt net zo goed zeggen dat een wiskundeboek 4x minder tekst heeft, en dat je dat na 1 keer lezen ook snapt.
Ik doe zelf een biochemie-opleiding en ik merk juist dat ik de biologie altijd onderschat. Met wis of scheikunde is het zo makkelijk om precies te weten hoe je iets onder de knie krijgt.
En dat zeg ik als geheugenwonder.
Iets kunnen is natuurlijk anders dan begrijpen en kunnen bewijzen waarom iets zo is. ;)
quote:
En daarvan los nog staande de labskills die je nodig hebt om als wetenschapper in de moleculaire&cellbiologie/biochemie iets klaar te spelen. Dat haal je niet uit een boekje.
Als systeem bioloog/mathematisch celbioloog heb je toch geen lab skills nodig?
  maandag 2 maart 2015 @ 18:03:05 #47
122648 Bravebart
København er på plads ja
pi_150222246
quote:
0s.gif Op maandag 2 maart 2015 17:23 schreef Pandarus het volgende:
Als je vindt dat discussie geen nut heeft en dat dat aan die user ligt, is dat het logische vervolg.

Raar dat je anderen oproept te stoppen met reageren op uitspraken van een ander.
Ik heb de politie al gebeld, ze gaan zo langs bij Virgiel.
Op donderdag 22 november 2012 00:14 schreef ondeugend het volgende:
liefdevolle gevoelens voor de duisternis
pi_150222291
quote:
0s.gif Op maandag 2 maart 2015 17:15 schreef Anoonumos het volgende:

[..]

Niet gelezen maar eens met Bram.
:')
Gist is liefde, gist is leven. Vooral in een vagijn.
pi_150222307
Nieuwe station in Delft is trouwens wel mooi. _O_
Gist is liefde, gist is leven. Vooral in een vagijn.
pi_150222328
quote:
7s.gif Op maandag 2 maart 2015 18:03 schreef Bravebart het volgende:

[..]

Ik heb de politie al gebeld, ze gaan zo langs bij Virgiel.
Is Mitsu lid van Virgiel?
abonnement Unibet Coolblue
Forum Opties
Forumhop:
Hop naar:
(afkorting, bv 'KLB')