COR Corona COVID-19 forum
Alles over het corona / COVID-19 virus.
Aangezien het andere topic volloopt met klaagzangen vond ik het tijd voor een eigen topic. Want het is de afgelopen dagen nogal vaak over de vertraging gegaan m.b.t. tot de doorgifte van de cijfers richting het RIVM.
Om een simpel voorbeeld aan te halen heb ik eens de cijfers van vandaag erbij gepakt. Deze zijn hier te vinden: https://data.rivm.nl/covid-19/
Daar kun je onder andere een databestand vinden met daarin alle 262.405 positieve testen die doorgegeven zijn aan het RIVM. Je kunt ook de data analyseren, wat ik dus even snel gedaan heb. Ik kwam tot de volgende grafiek:
Wat je ziet zijn een aantal lijnen:
- BLAUWE lijn: totale aantal meldingen voor de betreffende dag
- ORANJE lijn: DOO (= Date of Disease Onset), oftewel de de eerste ziektedag zoals gemeld bij de GGD.
- GELE lijn: de lijn waarbij ik gecorrigeerd heb voor het feit dat het % DOO per dag kan verschillen. In dit geval heb ik de correctie zo toegepast om te komen tot overal 80% DOO (dat is ongeveer het gemiddelde dat gerapporteerd wordt).
- GRIJZE stippellijn: het percentage DOO van het totaal
In alle lijnen is maandag 12 oktober tot nu toe het hoogtepunt, maar dat kan uiteraard veranderen zodra er meer data binnenkomt. Bedenk ook dat 12 oktober het hoogtepunt is voor DOO, dus dat betekent dat die mensen gemiddeld zo'n zes dagen daarvoor pas besmet zijn geraakt.
Om een simpel voorbeeld aan te halen heb ik eens de cijfers van vandaag erbij gepakt. Deze zijn hier te vinden: https://data.rivm.nl/covid-19/
Daar kun je onder andere een databestand vinden met daarin alle 262.405 positieve testen die doorgegeven zijn aan het RIVM. Je kunt ook de data analyseren, wat ik dus even snel gedaan heb. Ik kwam tot de volgende grafiek:
Wat je ziet zijn een aantal lijnen:
- BLAUWE lijn: totale aantal meldingen voor de betreffende dag
- ORANJE lijn: DOO (= Date of Disease Onset), oftewel de de eerste ziektedag zoals gemeld bij de GGD.
- GELE lijn: de lijn waarbij ik gecorrigeerd heb voor het feit dat het % DOO per dag kan verschillen. In dit geval heb ik de correctie zo toegepast om te komen tot overal 80% DOO (dat is ongeveer het gemiddelde dat gerapporteerd wordt).
- GRIJZE stippellijn: het percentage DOO van het totaal
In alle lijnen is maandag 12 oktober tot nu toe het hoogtepunt, maar dat kan uiteraard veranderen zodra er meer data binnenkomt. Bedenk ook dat 12 oktober het hoogtepunt is voor DOO, dus dat betekent dat die mensen gemiddeld zo'n zes dagen daarvoor pas besmet zijn geraakt.
Cum hoc ergo propter hoc (correlation does NOT imply causation)
De coronacijfers van vandaag zijn een achteruitkijkspiegel van één à twee weken terug: COR / Het datavertragingstopic #2
De coronacijfers van vandaag zijn een achteruitkijkspiegel van één à twee weken terug: COR / Het datavertragingstopic #2
Overigens is dit mijn kort-door-de-bocht analyse. Gebruikers als @_serial_ hebben veel meer data nog.
Cum hoc ergo propter hoc (correlation does NOT imply causation)
De coronacijfers van vandaag zijn een achteruitkijkspiegel van één à twee weken terug: COR / Het datavertragingstopic #2
De coronacijfers van vandaag zijn een achteruitkijkspiegel van één à twee weken terug: COR / Het datavertragingstopic #2
Kloptquote:Op donderdag 22 oktober 2020 14:39 schreef DireStraits7 het volgende:
Overigens is dit mijn kort-door-de-bocht analyse. Gebruikers als @:_serial_ hebben veel meer data nog.
Piekdag staat (momenteel) nog steeds op 12-10 met 7931 besmettingen.
De eerste paar dagen van oktober krijgen bijna geen mutaties meer (1 okt : 21, 2 okt: 17, 3 okt: 24)
Dag met grootste mutatie : 21-10, 1821
Oudste mutatie : 7-8
wegmetdetestwet.nl / wegmetdetestmaatschappij.nl voor een gratis subdomain DM me.
Hoeveel mutaties voor 13-10/14-10?quote:
[..]
Klopt
Piekdag staat (momenteel) nog steeds op 12-10 met 7931 besmettingen.
De eerste paar dagen van oktober krijgen bijna geen mutaties meer (1 okt : 21, 2 okt: 17, 3 okt: 24)
Dag met grootste mutatie : 21-10, 1821
Oudste mutatie : 7-8
Cum hoc ergo propter hoc (correlation does NOT imply causation)
De coronacijfers van vandaag zijn een achteruitkijkspiegel van één à twee weken terug: COR / Het datavertragingstopic #2
De coronacijfers van vandaag zijn een achteruitkijkspiegel van één à twee weken terug: COR / Het datavertragingstopic #2
13-10-2020 365quote:
[..]
Hoeveel mutaties voor 13-10/14-10?
14-10-2020 619
15-10-2020 796
wegmetdetestwet.nl / wegmetdetestmaatschappij.nl voor een gratis subdomain DM me.
En hoe is dat ivm 12-10? Want 12-10 staat nu nog ruim 700 besmettingen 'voor'.quote:
[..]
13-10-2020 365
14-10-2020 619
15-10-2020 796
Cum hoc ergo propter hoc (correlation does NOT imply causation)
De coronacijfers van vandaag zijn een achteruitkijkspiegel van één à twee weken terug: COR / Het datavertragingstopic #2
De coronacijfers van vandaag zijn een achteruitkijkspiegel van één à twee weken terug: COR / Het datavertragingstopic #2
Klopt 12-10 staat met stip bovenaan in oktober.quote:
[..]
En hoe is dat ivm 12-10? Want 12-10 staat nu nog ruim 700 besmettingen 'voor'.
wegmetdetestwet.nl / wegmetdetestmaatschappij.nl voor een gratis subdomain DM me.
Daarbij moeten we ook rekening houden met het feit dat 12-10 een maandag is. Ook 5-10 was een redelijk grote uitschieter. Het lijkt me zeer onwaarschijnlijk dat de maandag significant vaker de eerste ziektedag is.quote:
[..]
En hoe is dat ivm 12-10? Want 12-10 staat nu nog ruim 700 besmettingen 'voor'.
Cum hoc ergo propter hoc (correlation does NOT imply causation)
De coronacijfers van vandaag zijn een achteruitkijkspiegel van één à twee weken terug: COR / Het datavertragingstopic #2
De coronacijfers van vandaag zijn een achteruitkijkspiegel van één à twee weken terug: COR / Het datavertragingstopic #2
We hebben eigenlijk geen echt weekend effect meer.quote:
[..]
Daarbij moeten we ook rekening houden met het feit dat 12-10 een maandag is. Ook 5-10 was een redelijk grote uitschieter. Het lijkt me zeer onwaarschijnlijk dat de maandag significant vaker de eerste ziektedag is.
Het kan natuurlijk te maken hebben dat ze vanaf die dag meer testcapaciteit gekregen hebben.
wegmetdetestwet.nl / wegmetdetestmaatschappij.nl voor een gratis subdomain DM me.
Toch zie je dat effect wel degelijk. Ook op 28-09 zie je een piek in zowel het totaal als het aantal DOO.quote:
[..]
We hebben eigenlijk geen echt weekend effect meer.
Het kan natuurlijk te maken hebben dat ze vanaf die dag meer testcapaciteit gekregen hebben.
Cum hoc ergo propter hoc (correlation does NOT imply causation)
De coronacijfers van vandaag zijn een achteruitkijkspiegel van één à twee weken terug: COR / Het datavertragingstopic #2
De coronacijfers van vandaag zijn een achteruitkijkspiegel van één à twee weken terug: COR / Het datavertragingstopic #2
Interessant topic, dank voor het opzetten! Ik weet niet goed hoe de bezetting van de GGD's is in de weekenden qua callcenter, dat kan ook wel een verschil verklaren. Slechter bereikbaar in weekend om afspraak te maken, dus maandag afspraak maken. Denk dat er nog veel mensen bellen en niet via de website een afspraak maken.quote:
[..]
Daarbij moeten we ook rekening houden met het feit dat 12-10 een maandag is. Ook 5-10 was een redelijk grote uitschieter. Het lijkt me zeer onwaarschijnlijk dat de maandag significant vaker de eerste ziektedag is.
Lid van de vaste commissie van het FOK!OMT
Maar dat zou voor de DOO niet uit moeten maken.quote:
[..]
Interessant topic, dank voor het opzetten! Ik weet niet goed hoe de bezetting van de GGD's is in de weekenden qua callcenter, dat kan ook wel een verschil verklaren. Slechter bereikbaar in weekend om afspraak te maken, dus maandag afspraak maken. Denk dat er nog veel mensen bellen en niet via de website een afspraak maken.
En ik had jou ook willen taggen, maar kon me niet meer heugen waar de R precies stond in jouw naam.
Cum hoc ergo propter hoc (correlation does NOT imply causation)
De coronacijfers van vandaag zijn een achteruitkijkspiegel van één à twee weken terug: COR / Het datavertragingstopic #2
De coronacijfers van vandaag zijn een achteruitkijkspiegel van één à twee weken terug: COR / Het datavertragingstopic #2
Dat zou natuurlijk goed kunnen. Maar het is wel bijzonder dat 12-10 zo enorm voor blijft lopen, al dagen lang.quote:
[..]
Interessant topic, dank voor het opzetten! Ik weet niet goed hoe de bezetting van de GGD's is in de weekenden qua callcenter, dat kan ook wel een verschil verklaren. Slechter bereikbaar in weekend om afspraak te maken, dus maandag afspraak maken. Denk dat er nog veel mensen bellen en niet via de website een afspraak maken.
wegmetdetestwet.nl / wegmetdetestmaatschappij.nl voor een gratis subdomain DM me.
Dat klopt, maar als je alleen naar DOO zou kijken, had 5-10 het hoogste aantal van de hele week. Tot 12-10 dus.quote:
[..]
Dat zou natuurlijk goed kunnen. Maar het is wel bijzonder dat 12-10 zo enorm voor blijft lopen, al dagen lang.
Wat mij betreft is DOO in theorie het beste aantal, omdat je dan grofweg terug kunt rekenen wanneer men besmet is geraakt.
Cum hoc ergo propter hoc (correlation does NOT imply causation)
De coronacijfers van vandaag zijn een achteruitkijkspiegel van één à twee weken terug: COR / Het datavertragingstopic #2
De coronacijfers van vandaag zijn een achteruitkijkspiegel van één à twee weken terug: COR / Het datavertragingstopic #2
DOO blijft natuurlijk gewoon een onzekerheidquote:
[..]
Maar dat zou voor de DOO niet uit moeten maken.
En ik had jou ook willen taggen, maar kon me niet meer heugen waar de R precies stond in jouw naam.
Eigenlijk geeft DOO alleen maar ruis in de cijfers. Als ze gewoon DPL of DON aanhouden is het duidelijk voor iedereen, dan betreft het gewoon positief op datum x
wegmetdetestwet.nl / wegmetdetestmaatschappij.nl voor een gratis subdomain DM me.
Bij DON weet je nog steeds niet wat de vertraging is geweest tussen de test en het doorgeven. En bij DPL weet je niet wat de vertraging is geweest tussen de klachten en de test.quote:
Als ze gewoon DPL of DON aanhouden is het duidelijk voor iedereen, dan betreft het gewoon positief op datum x
Het RIVM hanteert niet voor niets voor 80% DOO lijkt me.
Cum hoc ergo propter hoc (correlation does NOT imply causation)
De coronacijfers van vandaag zijn een achteruitkijkspiegel van één à twee weken terug: COR / Het datavertragingstopic #2
De coronacijfers van vandaag zijn een achteruitkijkspiegel van één à twee weken terug: COR / Het datavertragingstopic #2
Nee, maar dat blijft een algeheel nadeel in de dataset, er is geen unique identifier per record.quote:
[..]
Bij DON weet je nog steeds niet wat de vertraging is geweest tussen de test en het doorgeven. En bij DPL weet je niet wat de vertraging is geweest tussen de klachten en de test.
Het RIVM hanteert niet voor niets voor 80% DOO lijkt me.
wegmetdetestwet.nl / wegmetdetestmaatschappij.nl voor een gratis subdomain DM me.
Het allerbeste zou een unieke sleutel zijn. Gewoon een guid in elk veld opnemen zodat een melding die wijzigt terug te relateren is aan die melding. Dan kun je de wijzigingen volgen 
Ik verwacht alleen niet dat ze dat zullen doen, dus blijft 't bij wensdenken.
Ik verwacht alleen niet dat ze dat zullen doen, dus blijft 't bij wensdenken.
Lid van de vaste commissie van het FOK!OMT
Rode lijn is een moving average (5 dagen) van de gecorrigeerde lijn:Je ziet duidelijk dat de lijn aan het afbuigen is.
Je ziet duidelijk dat de lijn aan het afbuigen is.
Cum hoc ergo propter hoc (correlation does NOT imply causation)
De coronacijfers van vandaag zijn een achteruitkijkspiegel van één à twee weken terug: COR / Het datavertragingstopic #2
De coronacijfers van vandaag zijn een achteruitkijkspiegel van één à twee weken terug: COR / Het datavertragingstopic #2
Ik ben trouwens een aan 't zoeken geweest naar andere datasets die publiek zijn die mogelijkerwijs een indicatie van mobiliteit kunnen geven, en dacht ineens aan mobiele data. Mobiele data wordt gepeered via de IX'en van de Ams-Ix, en die statistieken zijn publiek.
Hier even de bron
Ik ga er vanuit dat het gros van de mensen als ze thuis of op kantoor zijn gebruik maken van Wireless, en niet 4G. Deze cijfers zijn geaggregeerd over alle providers enzo heen, dus geven alleen als totaal enige indicatie.
Kijken we hiernaar zie je dat maart er een afname was, april enzo het erg laag was en juni weer begon toe te nemen. We zien wel weer een daling, dus het lijkt in elk geval dat mensen weer meer binnen zijn.
Allesbehalve perfect, maar wel een mooie indicator wellicht
Hier even de bron
Ik ga er vanuit dat het gros van de mensen als ze thuis of op kantoor zijn gebruik maken van Wireless, en niet 4G. Deze cijfers zijn geaggregeerd over alle providers enzo heen, dus geven alleen als totaal enige indicatie.
Kijken we hiernaar zie je dat maart er een afname was, april enzo het erg laag was en juni weer begon toe te nemen. We zien wel weer een daling, dus het lijkt in elk geval dat mensen weer meer binnen zijn.
Allesbehalve perfect, maar wel een mooie indicator wellicht
Lid van de vaste commissie van het FOK!OMT
Hier kun je een grove indicator vinden van de drukte in Amsterdam: https://citymapper.com/cmi/randstad
Cum hoc ergo propter hoc (correlation does NOT imply causation)
De coronacijfers van vandaag zijn een achteruitkijkspiegel van één à twee weken terug: COR / Het datavertragingstopic #2
De coronacijfers van vandaag zijn een achteruitkijkspiegel van één à twee weken terug: COR / Het datavertragingstopic #2
Iets duidelijkere grafiek (met % DOO):quote:
Rode lijn is een moving average (5 dagen) van de gecorrigeerde lijn:[ afbeelding ]Je ziet duidelijk dat de lijn aan het afbuigen is.
Cum hoc ergo propter hoc (correlation does NOT imply causation)
De coronacijfers van vandaag zijn een achteruitkijkspiegel van één à twee weken terug: COR / Het datavertragingstopic #2
De coronacijfers van vandaag zijn een achteruitkijkspiegel van één à twee weken terug: COR / Het datavertragingstopic #2
Cum hoc ergo propter hoc (correlation does NOT imply causation)
De coronacijfers van vandaag zijn een achteruitkijkspiegel van één à twee weken terug: COR / Het datavertragingstopic #2
De coronacijfers van vandaag zijn een achteruitkijkspiegel van één à twee weken terug: COR / Het datavertragingstopic #2
Topper. Dat is in elk geval stap 1. Volgende stap: daling.quote:
[..]
Iets duidelijkere grafiek (met % DOO):
[ afbeelding ]
Lid van de vaste commissie van het FOK!OMT
Met het toenemende aantal testen denk ik niet dat dat snel gaat gebeuren, maar wie weet.quote:
[..]
Topper. Dat is in elk geval stap 1. Volgende stap: daling.
Cum hoc ergo propter hoc (correlation does NOT imply causation)
De coronacijfers van vandaag zijn een achteruitkijkspiegel van één à twee weken terug: COR / Het datavertragingstopic #2
De coronacijfers van vandaag zijn een achteruitkijkspiegel van één à twee weken terug: COR / Het datavertragingstopic #2
