FOK!forum / General Chat / DNA uitlezen
#ANONIEMzaterdag 24 augustus 2019 @ 10:48
Is er een onderzoeks bureau waar ik mijn DNA kan laten uitlezen.
Hun mogen het daarna gebruiken voor onderzoeken etc maar ik zou graag mijn DNA digitaal willen.

Ik gok dat het een terabyte aan ruwe data is maar ben nieuwschierig naar.

Dus hoe kan ik dit doen?
SpecialKzaterdag 24 augustus 2019 @ 11:40
Volgens mij past het gehele menselijke genoom op 3 of 4 floppy drives.
#ANONIEMzaterdag 24 augustus 2019 @ 11:42
quote:
0s.gif Op zaterdag 24 augustus 2019 11:40 schreef SpecialK het volgende:
Volgens mij past het gehele menselijke genoom op 3 of 4 floppy drives.
Denk zelf dat je in de gigabytes zit.
Maar opslag kost geen flikker
SpecialKzaterdag 24 augustus 2019 @ 11:48
quote:
1s.gif Op zaterdag 24 augustus 2019 11:42 schreef Tailless het volgende:

[..]

Denk zelf dat je in de gigabytes zit.
Maar opslag kost geen flikker
Ik heb het even opgezocht.

https://bitesizebio.com/8(...)in-the-human-genome/

Volgens hun 1,5 GB

Die 4MB waar ik aan dacht is als je jouw specifieke variaties neemt in vergelijking met een gemiddelde menselijke referentie.
#ANONIEMzaterdag 24 augustus 2019 @ 11:48
quote:
0s.gif Op zaterdag 24 augustus 2019 11:48 schreef SpecialK het volgende:

[..]

Ik heb het even opgezocht.

https://bitesizebio.com/8(...)in-the-human-genome/

Volgens hun 1,5 GB

Die 4MB waar ik aan dacht is als je jouw specifieke variaties neemt in vergelijking met een gemiddelde menselijke referentie.
Prima. Nu is de vraag hoe krijg ik die gegevens op een sticky
SpecialKzaterdag 24 augustus 2019 @ 11:49
quote:
1s.gif Op zaterdag 24 augustus 2019 11:48 schreef Tailless het volgende:

[..]

Prima. Nu is de vraag hoe krijg ik die gegevens op een sticky
Volgens mij wat de meeste van deze bedrijven doen is niet je hele DNA sequencen maar ze zoeken naar bepaalde typische markers waarmee ze je interessante stukjes info kan geven.

Dus ik denk dat wat je vraagt een specifiekje is waar je een speciaal bedrijf voor moet vinden.
Shivozaterdag 24 augustus 2019 @ 12:16
Wij lezen DNA routine matig uit, in het lab. Wat dacht je met die data te gaan doen? Zonder verdere analyse is het niet meer dan 3.6 miljard A-C-G-Ts waar je niks aan af kunt lezen. En realiseer je dat je mer het delen van je eigen DNA, ook de helft van het DNA van je ouders en je kinderen deelt. Die zitten daar misschien helemaal niet op te wachten.
#ANONIEMzaterdag 24 augustus 2019 @ 12:23
Je stond op de kieslijst van de Piratenpartij, en wil nu je DNA gaan delen met een commerciële partij? :')

Sluit je dan gelijk bij het CDA aan als je niks om privacy geeft.
Fok-itzaterdag 24 augustus 2019 @ 12:38
quote:
10s.gif Op zaterdag 24 augustus 2019 12:23 schreef d4v1d het volgende:
Je stond op de kieslijst van de Piratenpartij, en wil nu je DNA gaan delen met een commerciële partij? :')
Haha wat :')

Deze ts :') _O-
Man-Bear-Pigzaterdag 24 augustus 2019 @ 12:49
quote:
0s.gif Op zaterdag 24 augustus 2019 11:48 schreef SpecialK het volgende:

[..]

Ik heb het even opgezocht.

https://bitesizebio.com/8(...)in-the-human-genome/

Volgens hun 1,5 GB

Die 4MB waar ik aan dacht is als je jouw specifieke variaties neemt in vergelijking met een gemiddelde menselijke referentie.
Dit is eigenlijk nog maar de helft ;) wanneer je de ene helft weet, kun je de andere helft afleiden.

OT: het is niet zo simpel om je hele genoom te achterhalen. Er is nog geen sequencer die je hele genoom kan lezen omdat DNA behoorlijk fragiel is. De oplossing is om je DNA eerst te vermenigvuldigen, in stukken breken en die daarna weer aan elkaar plakken door middel van algoritmen. De overlappen tussen de stukken zorgen ervoor dat niet elk stukje met 100% precisie weer op de juiste plek komt. Als je meer wil weten moet je “shotgun sequencing” en “de bruijn graphs” googlen.

Wat vaker wordt gedaan is exoom sequencing, waarbij alleen je genen die tot eiwitten leiden worden gesequenced. Bedrijfjes zoals 23andme doen dat voor ongeveer 100 eu. Leuk om eens te doen voor als je wil weten wat voor genetische aanleg je hebt :)

(Ik werk als bioinformaticus en heb hier regelmatig mee te maken)
Shivozaterdag 24 augustus 2019 @ 13:04
23andme doet geen exomes voor ¤100, maar een custom SNP panel, volgens mij met een Affy of Agilent chip.
Man-Bear-Pigzaterdag 24 augustus 2019 @ 13:34
quote:
1s.gif Op zaterdag 24 augustus 2019 13:04 schreef Shivo het volgende:
23andme doet geen exomes voor ¤100, maar een custom SNP panel, volgens mij met een Affy of Agilent chip.
Ah excuses, ik dacht dat het exome sequencing was.
#ANONIEMzaterdag 24 augustus 2019 @ 14:07
quote:
10s.gif Op zaterdag 24 augustus 2019 12:23 schreef d4v1d het volgende:
Je stond op de kieslijst van de Piratenpartij, en wil nu je DNA gaan delen met een commerciële partij? :')

Sluit je dan gelijk bij het CDA aan als je niks om privacy geeft.
Commerciële ? Wetenschappelijk niet reclame doeleinde
Farenjizaterdag 24 augustus 2019 @ 14:16
quote:
1s.gif Op zaterdag 24 augustus 2019 14:07 schreef Tailless het volgende:

[..]

Commerciële ? Wetenschappelijk niet reclame doeleinde
Als die diensten als myheritage etc bieden hun diensten zo goedkoop aan omdat ze al jouw data in hun db opslaan en het ook voor allerlei andere doeleinden gebruiken. Ze hebben inmiddels een uitgebreide wereldwijde dna db waar ze heel veel mee kunnen en dat kan heel privacy gevoelig zijn. Wil je daar niet bij dan zul je waarschijnlijk heel wat dieper in de buidel moeten tasten. Is dat het waard, voor een betekenisloze brij aan actg's? Wat wil je ermee?
Jantje2kzaterdag 24 augustus 2019 @ 19:59
Waarom zou je dit willen?
#ANONIEMzaterdag 24 augustus 2019 @ 21:42
quote:
1s.gif Op zaterdag 24 augustus 2019 14:16 schreef Farenji het volgende:

[..]

Als die diensten als myheritage etc bieden hun diensten zo goedkoop aan omdat ze al jouw data in hun db opslaan en het ook voor allerlei andere doeleinden gebruiken. Ze hebben inmiddels een uitgebreide wereldwijde dna db waar ze heel veel mee kunnen en dat kan heel privacy gevoelig zijn. Wil je daar niet bij dan zul je waarschijnlijk heel wat dieper in de buidel moeten tasten. Is dat het waard, voor een betekenisloze brij aan actg's? Wat wil je ermee?
Daarom zal ik het ook niet bij zo een partij doen
Zalmslaatjezaterdag 24 augustus 2019 @ 22:07
quote:
0s.gif Op zaterdag 24 augustus 2019 12:16 schreef Shivo het volgende:
Wij lezen DNA routine matig uit, in het lab. Wat dacht je met die data te gaan doen? Zonder verdere analyse is het niet meer dan 3.6 miljard A-C-G-Ts waar je niks aan af kunt lezen. En realiseer je dat je mer het delen van je eigen DNA, ook de helft van het DNA van je ouders en je kinderen deelt. Die zitten daar misschien helemaal niet op te wachten.
Met de huidige stand van zaken, wat voor harde conclusies kan je trekken uit de data van een willekeurig persoon?

Dus niet zoveel % kans op een of andere erfelijke aandoening, maar echt harde feiten?

Maw, als een analist mijn dna-record krijgt wat kan hij of zij dan met zekerheid over mijn persoon(lijkheid) zeggen?
Shivozaterdag 24 augustus 2019 @ 22:21
Vrij weinig, hoogstens een paar specifieke dingen als haar- en oogkleur (een beter dan de ander) en zeker geen dingen als gezichtskenmerken of persoonlijkheid.
Zalmslaatjezaterdag 24 augustus 2019 @ 22:32
Maar op het gebied van verwantschap en afkomst kan men toch wel iets specifieker zijn?
Shivozaterdag 24 augustus 2019 @ 22:38
Ja, wel iets. Maar het blijven voorspellingen met percentages, land van oorsprong is nog lang geen uitgemaakte zaak. Wat daar natuurlijk meespeelt is dat de mens steeds mobieler wordt, en over de hele wereld verhuisd. Zo wonen er een miljoen Nederlanders in het buitenland!
Zalmslaatjezaterdag 24 augustus 2019 @ 22:53
Heb ooit op een gen-lab gewerkt en als ik vroeg hoe genen werken kreeg ik altijd een mooi beeldend verhaal dat best begrijpelijk was en daarna meteen de disclaimer dat het technisch niet klopte maar dat de materie anders helemaal onbegrijpelijk zou zijn.

Ik vind het wel sympathiek dat duur betaalde professionals durven toegeven dat ze eigenlijk niet precies weten waar ze mee bezig zijn :P

[ Bericht 19% gewijzigd door Zalmslaatje op 24-08-2019 23:06:46 ]
Farenjizondag 25 augustus 2019 @ 00:01
quote:
1s.gif Op zaterdag 24 augustus 2019 21:42 schreef Tailless het volgende:

[..]

Daarom zal ik het ook niet bij zo een partij doen
Waar dan wel? En wat kost dat?
#ANONIEMzondag 25 augustus 2019 @ 00:15
quote:
0s.gif Op zaterdag 24 augustus 2019 12:16 schreef Shivo het volgende:
Wij lezen DNA routine matig uit, in het lab. Wat dacht je met die data te gaan doen? Zonder verdere analyse is het niet meer dan 3.6 miljard A-C-G-Ts waar je niks aan af kunt lezen. En realiseer je dat je mer het delen van je eigen DNA, ook de helft van het DNA van je ouders en je kinderen deelt. Die zitten daar misschien helemaal niet op te wachten.
Mijn ouders vinden het prima mits voor wetenschap en data naar mezelf.

Dus het zal ongeveer 1,5 GB in beslag nemen in ruwe vorm.
Ik wil het gewoon hebben misschien zou ik ooit ermee gekloond kunnen worden. ( nee ben gewoon nieuwschierig en wil mezelf vergelijken met fruit etc
#ANONIEMzondag 25 augustus 2019 @ 00:16
quote:
1s.gif Op zondag 25 augustus 2019 00:01 schreef Farenji het volgende:

[..]

Waar dan wel? En wat kost dat?
Geen idee he daarom de vraag.
Waar wel ja gewoon een universiteit ofzo. Bedrijven zonder winst opmerk die mijn gegevens niet doorverkopen of weggeven.
Farenjizondag 25 augustus 2019 @ 00:16
quote:
1s.gif Op zondag 25 augustus 2019 00:16 schreef Tailless het volgende:

[..]

Geen idee he daarom de vraag.
Waar wel ja gewoon een universiteit ofzo. Bedrijven zonder winst opmerk die mijn gegevens niet doorverkopen of weggeven.
Wat is je budget?
Werkperdzondag 25 augustus 2019 @ 01:32
Eerst zeg je 1TB en daarna kom je met 1.5GB.

Verdwaald gastje.
#ANONIEMzondag 25 augustus 2019 @ 08:39
quote:
0s.gif Op zondag 25 augustus 2019 01:32 schreef Werkperd het volgende:
Eerst zeg je 1TB en daarna kom je met 1.5GB.

Verdwaald gastje.
3,6 miljard met 4 opties is 1.5 gb
#ANONIEMzondag 25 augustus 2019 @ 08:39
quote:
1s.gif Op zondag 25 augustus 2019 00:16 schreef Farenji het volgende:

[..]

Wat is je budget?
Wat kost het
Basp1zondag 25 augustus 2019 @ 08:56
quote:
1s.gif Op zondag 25 augustus 2019 00:15 schreef Tailless het volgende:
( nee ben gewoon nieuwschierig en wil mezelf vergelijken met fruit etc
Wat maakt het dan uit of je een willekeurig menselijk DNA met fruit vergelijkt of juist die specifieke van jou waar een minimale afwijking in zit ten opzichte van een willekeurig mens. :D
Man-Bear-Pigzondag 25 augustus 2019 @ 08:58
quote:
1s.gif Op zondag 25 augustus 2019 08:39 schreef Tailless het volgende:

[..]

Wat kost het
~1000 eu
#ANONIEMzondag 25 augustus 2019 @ 09:05
quote:
0s.gif Op zondag 25 augustus 2019 08:56 schreef Basp1 het volgende:

[..]

Wat maakt het dan uit of je een willekeurig menselijk DNA met fruit vergelijkt of juist die specifieke van jou waar een minimale afwijking in zit ten opzichte van een willekeurig mens. :D
Ik wil het gewoon hebben ja. Het is een obsessie om zo een data bank van mezelf te hebben.
Basp1zondag 25 augustus 2019 @ 09:11
quote:
1s.gif Op zondag 25 augustus 2019 09:05 schreef Tailless het volgende:

[..]

Ik wil het gewoon hebben ja. Het is een obsessie om zo een data bank van mezelf te hebben.
Zoals ik hier tussen de regels leest kun je wel wat stukjes kopen maar wordt op dit moment nog steeds niet je gehele DNA gelezen.
#ANONIEMzondag 25 augustus 2019 @ 09:45
quote:
0s.gif Op zondag 25 augustus 2019 09:11 schreef Basp1 het volgende:

[..]

Zoals ik hier tussen de regels leest kun je wel wat stukjes kopen maar wordt op dit moment nog steeds niet je gehele DNA gelezen.
Dat less ik ook. Dus iemand die een afstudeerproject wil doen om de gehele mensenelijke DNA uit te lezen?

Ik meld me aan als test
#ANONIEMzondag 25 augustus 2019 @ 09:59
https://www.eoswetenschap(...)dna-staat-geschreven
Werkperdzondag 25 augustus 2019 @ 11:16
Bedrijven bieden alleen autosomale DNA's testen aan. Die ik heb is maar 20mb en is een lange waslijst met snp's. Bij FTDNA kun je ook Y-DNA testen aanvragen. De big Y-700 loopt op naar 650 dollar. Deze zijn natuurlijk allemaal bedoeld om je afstammeling uit te puzzelen.

Wat jij wil is heel wat anders. Denk niet dat zij zo iets kunnen leveren en anders moet je persoonlijk langs een laboratorium gaan en jezelf als proefkonijn melden.