FOK!forum / Digital Corner / Omzetten van text-images -> jpg in bulk.
Isdatzozondag 17 december 2017 @ 14:23
Ik heb hier een stapel .csv-bestanden uit een elektronenmicroscoop die ik even snel om wil zetten naar jpg voor een eerste beoordeling.

Nu zou het handig zijn als ik software had die dat als batch kon doen. Iemand suggesties? Ik heb gisteravond al even gezocht maar zo snel niks kunnen vinden.
RM-rfzondag 17 december 2017 @ 14:24
Imagemagick misschien?
Atmozzondag 17 december 2017 @ 14:26
quote:
2s.gif Op zondag 17 december 2017 14:23 schreef Isdatzo het volgende:
Ik heb hier een stapel .csv-bestanden uit een elektronenmicroscoop die ik even snel om wil zetten naar jpg voor een eerste beoordeling.

Nu zou het handig zijn als ik software had die dat als batch kon doen. Iemand suggesties? Ik heb gisteravond al even gezocht maar zo snel niks kunnen vinden.
CSV-bestanden omzetten naar JPG?
Wat bedoel je daarmee precies? De tekst (in die CSV's) omzetten naar JPG?

[ Bericht 41% gewijzigd door Atmoz op 17-12-2017 14:35:28 ]
nostrazondag 17 december 2017 @ 14:27
https://www.xnview.com/en/xnconvert/
Isdatzozondag 17 december 2017 @ 15:18
quote:
0s.gif Op zondag 17 december 2017 14:24 schreef RM-rf het volgende:
Imagemagick
Nope, hij lust geen .csv-files. Wel .txt maar volgens mij niet in het format zoals ik ze heb staan, dan zou ik ze eerst om moeten zetten (omslachtig).

quote:
:N

Kan wel exporteren als csv maar niet importeren.
quote:
0s.gif Op zondag 17 december 2017 14:26 schreef Atmoz het volgende:

[..]

CSV-bestanden omzetten naar JPG?
Wat bedoel je daarmee precies? De tekst (in die CSV's) omzetten naar JPG?
Nee, de pixelwaarden vastgelegd in een .csv-bestand. Voorbeeld:

Bestand: http://isthatso.nl/Pos_0011BSE.csv

Bijbehorend plaatje (linksonder): 11.jpg

Zo heb ik er een paar honderd. Met ImageJ kan ik ze importeren en opslaan als JPG, maar niet als batch. Zelfde geldt voor de software bij de elektronenmicroscoop (handig).

[ Bericht 0% gewijzigd door Isdatzo op 17-12-2017 15:30:36 ]
Atmozzondag 17 december 2017 @ 15:36
quote:
7s.gif Op zondag 17 december 2017 15:18 schreef Isdatzo het volgende:

[..]

Nope, hij lust geen .csv-files. Wel .txt maar volgens mij niet in het format zoals ik ze heb staan, dan zou ik ze eerst om moeten zetten (omslachtig).

[..]

:N

Kan wel exporteren als csv maar niet importeren.

[..]

Nee, de pixelwaarden vastgelegd in een .csv-bestand. Voorbeeld:

Bestand: http://isthatso.nl/Pos_0011BSE.csv

Bijbehorend plaatje (linksonder): [ afbeelding ]

Zo heb ik er een paar honderd. Met ImageJ kan ik ze importeren en opslaan als JPG, maar niet als batch. Zelfde geldt voor de software bij de elektronenmicroscoop (handig).
Welke stappen doe je in ImageJ om de CSV's te converteren naar JPG?
Ik krijg het zo 1, 2, 3 niet voor elkaar met je voorbeeld-file....

[edit]

Oh, wacht nu wel :)


[edit2]

Kun je hier niets mee? https://imagej.nih.gov/ij/macros/examples/
Isdatzozondag 17 december 2017 @ 15:44
Ik zag daar zo niet direct iets tussen zitten, maar ik kan natuurlijk zelf proberen een macro te schrijven.
Atmozzondag 17 december 2017 @ 15:47
quote:
7s.gif Op zondag 17 december 2017 15:44 schreef Isdatzo het volgende:
Ik zag daar zo niet direct iets tussen zitten, maar ik kan natuurlijk zelf proberen een macro te schrijven.
Met dit lukt het:

run("Text Image... ", "open=D:\\ImageJ\\a.csv");
saveAs("Jpeg", "D:\\ImageJ\\a.jpg");
Isdatzozondag 17 december 2017 @ 16:32
Ja, ik het het nu zo gedaan:

dir1 = getDirectory("Source");
dir2 = getDirectory("Destination");
list = getFileList(dir1);
directory = getDirectory("Choose directory");
fileList = getFileList(directory);
for (i=0; i<fileList.length; i++) {
file = directory + fileList[i];
run("Text Image... ", "open=[" + file + "]");
run("Sharpen");
saveAs("Jpeg", dir2+list[i]);
close();
}
Aaargh!zondag 17 december 2017 @ 17:55
quote:
7s.gif Op zondag 17 december 2017 15:18 schreef Isdatzo het volgende:
Nee, de pixelwaarden vastgelegd in een .csv-bestand. Voorbeeld:

Bestand: http://isthatso.nl/Pos_0011BSE.csv

Bijbehorend plaatje (linksonder): [ afbeelding ]
Tering, ik kan er even niet bij waarom je ooit zoiets als een CSV bestand zou willen opslaan, laat staan dat het het default formaat is. WTF>
Isdatzozondag 17 december 2017 @ 22:10
quote:
0s.gif Op zondag 17 december 2017 17:55 schreef Aaargh! het volgende:

[..]

Tering, ik kan er even niet bij waarom je ooit zoiets als een CSV bestand zou willen opslaan, laat staan dat het het default formaat is. WTF>
Nou, de standaard output zijn .map-bestanden die alleen te openen zijn in de software van het operating station. Vanuit daar kan ik een export maken naar .csv en .bmp, en die laatste alleen in lage resolutie. En ook dat exporteren naar .csv moest stuk voor stuk. Dit keer waren het 95 samples (met 3 'soorten' foto's per sample), dus het was op zich wel te doen maar leuk is anders.

Het is inderdaad opmerkelijk dat bij zulke dure apparaten de software echt belachelijk onhandig en beperkt is wat het exporteren van data betreft. Dit is geen uitzondering helaas.

Vaak is er voor data in tekst-format wel iets te zeggen omdat je er daarna nog alle kanten mee opkan en niet gebonden bent aan bepaalde softwarepakketten. Deze samples stop ik hierna in een ander apparaat (voor isotopenanalyse) en dan ben ik juist heel blij dat de outputfiles .txt zijn :P .
Individualdinsdag 19 december 2017 @ 14:07
https://convertio.co/nl/csv-jpg/

Google gaf dit als 1e antwoord of doet Google dit niet goed?