DIG Digital Corner
Alles wat je altijd al over computers, hardware, software, internet en elektronische gadgets had willen weten, maar niet op Tweakers.net durft te vragen.
Ik heb hier een stapel .csv-bestanden uit een elektronenmicroscoop die ik even snel om wil zetten naar jpg voor een eerste beoordeling.
Nu zou het handig zijn als ik software had die dat als batch kon doen. Iemand suggesties? Ik heb gisteravond al even gezocht maar zo snel niks kunnen vinden.
Nu zou het handig zijn als ik software had die dat als batch kon doen. Iemand suggesties? Ik heb gisteravond al even gezocht maar zo snel niks kunnen vinden.
Huilen dan.
Imagemagick misschien?
"Whatever you feel like: Life’s not one color, nor are you my only reader" - Ausonius, Epigrammata 25
CSV-bestanden omzetten naar JPG?quote:Op zondag 17 december 2017 14:23 schreef Isdatzo het volgende:
Ik heb hier een stapel .csv-bestanden uit een elektronenmicroscoop die ik even snel om wil zetten naar jpg voor een eerste beoordeling.
Nu zou het handig zijn als ik software had die dat als batch kon doen. Iemand suggesties? Ik heb gisteravond al even gezocht maar zo snel niks kunnen vinden.
Wat bedoel je daarmee precies? De tekst (in die CSV's) omzetten naar JPG?
[ Bericht 41% gewijzigd door Atmoz op 17-12-2017 14:35:28 ]
Government is not the solution to our problem, government is the problem.
Far across the moonbeam I know that's who you are
Far across the moonbeam I know that's who you are
Nope, hij lust geen .csv-files. Wel .txt maar volgens mij niet in het format zoals ik ze heb staan, dan zou ik ze eerst om moeten zetten (omslachtig).quote:
quote:
Kan wel exporteren als csv maar niet importeren.
Nee, de pixelwaarden vastgelegd in een .csv-bestand. Voorbeeld:quote:Op zondag 17 december 2017 14:26 schreef Atmoz het volgende:
[..]
CSV-bestanden omzetten naar JPG?
Wat bedoel je daarmee precies? De tekst (in die CSV's) omzetten naar JPG?
Bestand: http://isthatso.nl/Pos_0011BSE.csv
Bijbehorend plaatje (linksonder):
Zo heb ik er een paar honderd. Met ImageJ kan ik ze importeren en opslaan als JPG, maar niet als batch. Zelfde geldt voor de software bij de elektronenmicroscoop (handig).
[ Bericht 0% gewijzigd door Isdatzo op 17-12-2017 15:30:36 ]
Huilen dan.
Welke stappen doe je in ImageJ om de CSV's te converteren naar JPG?quote:Op zondag 17 december 2017 15:18 schreef Isdatzo het volgende:
[..]
Nope, hij lust geen .csv-files. Wel .txt maar volgens mij niet in het format zoals ik ze heb staan, dan zou ik ze eerst om moeten zetten (omslachtig).
[..]
Kan wel exporteren als csv maar niet importeren.
[..]
Nee, de pixelwaarden vastgelegd in een .csv-bestand. Voorbeeld:
Bestand: http://isthatso.nl/Pos_0011BSE.csv
Bijbehorend plaatje (linksonder): [ afbeelding ]
Zo heb ik er een paar honderd. Met ImageJ kan ik ze importeren en opslaan als JPG, maar niet als batch. Zelfde geldt voor de software bij de elektronenmicroscoop (handig).
Ik krijg het zo 1, 2, 3 niet voor elkaar met je voorbeeld-file....
[edit]
Oh, wacht nu wel
[edit2]
Kun je hier niets mee? https://imagej.nih.gov/ij/macros/examples/
Ik zag daar zo niet direct iets tussen zitten, maar ik kan natuurlijk zelf proberen een macro te schrijven.
Huilen dan.
Met dit lukt het:quote:
Ik zag daar zo niet direct iets tussen zitten, maar ik kan natuurlijk zelf proberen een macro te schrijven.
run("Text Image... ", "open=D:\\ImageJ\\a.csv");
saveAs("Jpeg", "D:\\ImageJ\\a.jpg");
Ja, ik het het nu zo gedaan:
dir1 = getDirectory("Source");
dir2 = getDirectory("Destination");
list = getFileList(dir1);
directory = getDirectory("Choose directory");
fileList = getFileList(directory);
for (i=0; i<fileList.length; i++) {
file = directory + fileList[i];
run("Text Image... ", "open=[" + file + "]");
run("Sharpen");
saveAs("Jpeg", dir2+list[i]);
close();
}
dir1 = getDirectory("Source");
dir2 = getDirectory("Destination");
list = getFileList(dir1);
directory = getDirectory("Choose directory");
fileList = getFileList(directory);
for (i=0; i<fileList.length; i++) {
file = directory + fileList[i];
run("Text Image... ", "open=[" + file + "]");
run("Sharpen");
saveAs("Jpeg", dir2+list[i]);
close();
}
Huilen dan.
Tering, ik kan er even niet bij waarom je ooit zoiets als een CSV bestand zou willen opslaan, laat staan dat het het default formaat is. WTF>quote:
Nee, de pixelwaarden vastgelegd in een .csv-bestand. Voorbeeld:
Bestand: http://isthatso.nl/Pos_0011BSE.csv
Bijbehorend plaatje (linksonder): [ afbeelding ]
It is impossible to live a pleasant life without living wisely and well and justly.
And it is impossible to live wisely and well and justly without living a pleasant life.
And it is impossible to live wisely and well and justly without living a pleasant life.
Nou, de standaard output zijn .map-bestanden die alleen te openen zijn in de software van het operating station. Vanuit daar kan ik een export maken naar .csv en .bmp, en die laatste alleen in lage resolutie. En ook dat exporteren naar .csv moest stuk voor stuk. Dit keer waren het 95 samples (met 3 'soorten' foto's per sample), dus het was op zich wel te doen maar leuk is anders.quote:
[..]
Tering, ik kan er even niet bij waarom je ooit zoiets als een CSV bestand zou willen opslaan, laat staan dat het het default formaat is. WTF>
Het is inderdaad opmerkelijk dat bij zulke dure apparaten de software echt belachelijk onhandig en beperkt is wat het exporteren van data betreft. Dit is geen uitzondering helaas.
Vaak is er voor data in tekst-format wel iets te zeggen omdat je er daarna nog alle kanten mee opkan en niet gebonden bent aan bepaalde softwarepakketten. Deze samples stop ik hierna in een ander apparaat (voor isotopenanalyse) en dan ben ik juist heel blij dat de outputfiles .txt zijn
.
Huilen dan.
|
|
