Wetenschappers op FOK! #15

quote:

Op dinsdag 10 december 2013 15:05 schreef motorbloempje het volgende:
Herleiden is vaak niet zo'n probleem, maar hoe doe je het het makkelijkst de andere kant op, als je begint met een 'oud' artikel? Hoe vind je het makkelijkst wie dát artikel geciteerd heeft?

Kan toch gewoon met google scholar? cited by?

Ik heb zo'n gevoel dat deze cel me wat probeert te vertellen maar ik heb geen idee wat

quote:

Op vrijdag 13 december 2013 16:13 schreef Bosbeetle het volgende:
Ik heb zo'n gevoel dat deze cel me wat probeert te vertellen maar ik heb geen idee wat

[ afbeelding ]

Is de G-spot eindelijk ontdekt? Geen wonder dat ie zo lastig is te vinden, 10 micrometer

SPOILER

Om spoilers te kunnen lezen moet je zijn ingelogd. Je moet je daarvoor eerst gratis Registreren. Ook kun je spoilers niet lezen als je een ban hebt.

quote:

Op vrijdag 13 december 2013 16:14 schreef Norrage het volgende:

[..]

Is de G-spot eindelijk ontdekt? Geen wonder dat ie zo lastig is te vinden, 10 micrometer

SPOILER

Om spoilers te kunnen lezen moet je zijn ingelogd. Je moet je daarvoor eerst gratis Registreren. Ook kun je spoilers niet lezen als je een ban hebt.

ik had hem ook al gemaakt

Wetenschapshumor

Ik heb heel kort Operc ontmoet op een congres

quote:

Op dinsdag 10 december 2013 09:10 schreef Claudia_x het volgende:

[..]

Het mag, maar het is bij ons ook niet gebruikelijk om niks gepubliceerd te hebben. Eigenlijk hoor je wel 2 artikelen gepubliceerd of op z'n minst geaccepteerd voor publicatie te hebben.Maar het is geen harde regel; uiteindelijk is het gewoon de leescommissie die oordeelt over de kwaliteit van het proefschrift.

bij ons zijn de informele eisen veel hoger: minimaal 5 artikelen, en toch wel 3 geaccepteerd al. Ik had er zelf 10, 8 geaccepteerd. De eisen worden overigens vooral door de promotor zelf bepaald, die zal het pas opsturen aan leescommissie wanneer hij/zij het goed genoeg vindt voor zijn reputatie. Overleg dus goed met promotor in vroeg stadium hierover.

En soms kwaliteit over kwantiteit natuurlijk.

quote:

Op vrijdag 13 december 2013 19:04 schreef oompaloompa het volgende:
Ik heb heel kort Operc ontmoet op een congres

Dit dus Volgende keer wat langer?

quote:

Op vrijdag 13 december 2013 22:09 schreef Grumpey het volgende:

[..]

bij ons zijn de informele eisen veel hoger: minimaal 5 artikelen, en toch wel 3 geaccepteerd al. Ik had er zelf 10, 8 geaccepteerd. De eisen worden overigens vooral door de promotor zelf bepaald, die zal het pas opsturen aan leescommissie wanneer hij/zij het goed genoeg vindt voor zijn reputatie. Overleg dus goed met promotor in vroeg stadium hierover.

Overigens zie ik dat niet zozeer als hogere eisen maar als andere eisen. Je moet al die eisen bezien in het licht van de wetenschappelijke cultuur en tradities. Bij ons is het gebruikelijk om longitudinaal onderzoek te doen, drie jaar lang veldwerk te verrichten en om vier inhoudelijk omvangrijke artikelen te schrijven, hooguit vijf. De publicatiekansen zijn bovendien heel klein.

quote:

Op zaterdag 14 december 2013 08:44 schreef Operc het volgende:

[..]

Dit dus Volgende keer wat langer?

Zeker, volgende keer niet in de gang tijdens het weggaan

That said, jij zei dat je nog de stad in ging, heb er tot 5 uur staan dansen maar geen Operc gezien

quote:

Op vrijdag 13 december 2013 16:13 schreef Bosbeetle het volgende:
Ik heb zo'n gevoel dat deze cel me wat probeert te vertellen maar ik heb geen idee wat

[ afbeelding ]

Mooie kleuring!

Wat is dit precies? CD31 of iets in rood?

Confocaal ook?

quote:

Op vrijdag 13 december 2013 18:23 schreef MissGump het volgende:


Wetenschapshumor

quote:

Op zaterdag 14 december 2013 12:31 schreef oompaloompa het volgende:

[..]

Zeker, volgende keer niet in de gang tijdens het weggaan

That said, jij zei dat je nog de stad in ging, heb er tot 5 uur staan dansen maar geen Operc gezien

Ja sorry Geheel tegen de verwachting in bleek het centrum meer dan 1 kroeg te hebben.

quote:

Op zaterdag 14 december 2013 16:08 schreef Operc het volgende:

[..]

Ja sorry Geheel tegen de verwachting in bleek het centrum meer dan 1 kroeg te hebben.

Jokkebrok, ik heb nog doorgegeven waar we heengingen! 2 deuren naast waar ook een groep was, weet niet of jij daarbij was? Vanuit daar zijn we verder gegaan waar ook nog een groep congresgangers waren, je hebt me gewoon express ontweken

quote:

Op zaterdag 14 december 2013 13:10 schreef NaturalScience het volgende:

[..]

Mooie kleuring!

Wat is dit precies? CD31 of iets in rood?

Confocaal ook?

[..]

Nope niet confocaal, super-resolutie (SIM) in rood is actin en in groen is vinculin.

Oké, ik kan het niet laten om het te vragen. Wat (wat voor cel? Wat is groen/rood/geel gekleurd?) zien we precies op deze foto?

Heeft er hier ooit iemand een Marie Curie gekregen of in ieder geval aangevraagd?

quote:

Op zondag 15 december 2013 11:13 schreef Lyrebird het volgende:

[..]

Een Israelische collega van me in de VS had er een aangevraagd en gekregen. In zijn aanvraag had hij een voorstel zitten waarbij hij alle buzz-words van toen - is ondertussen al weer een jaar of 10 geleden - aan elkaar had geplakt. In zijn eigen woorden: I am very good at bullshitting. Geweldige kerel, ondanks alle bullshit een goede onderzoeker.

Ik wil over een aantal maanden iets indienen voor Rubicon en Marie Curie. De Rubicon klinkt als een nogal straight-forward aanvraagprocess en ik ken een aantal mensen die er 1 hebben gekregen en hun proposal willen delen. Het is me echter vrij onduidelijk wat nu precies de bedoeling is van de Marie Curie (helpt ook niet dat de heft van de informatie nog niet online staat omdat ze het stelsel veranderen). Ik zal de bullshit tip onthouden

quote:

Op zaterdag 14 december 2013 19:27 schreef Bram_van_Loon het volgende:
Oké, ik kan het niet laten om het te vragen. Wat (wat voor cel? Wat is groen/rood/geel gekleurd?) zien we precies op deze foto?

Wat voor cel dit is durf ik ook niet te zeggen. Maar het zou me niets verbazen als dit gewoon een Hela cel is (kankerlijn van endometrium weefsel).

Maar actine is gewoon een eiwit/onderdeel van het cytostekel van de cel. (Het kleurpatroon lijkt trouwens op F-actine?) Dat groene G gevormde ding is dus vinculin een adhesiemolecuul/membraaneiwit van de cel.

Een gele kleuring zit hier niet in. Interessant in dit plaatje is wel dat er geen DAPI kleuring is gebruikt om de kern aan te kleuren (in blauw).

Nu ik weet dat rood actine is vraag ik me wel af in hoeverre bosbeetle het rode signaal heeft weggefilterd aangezien je bij actine veel meer van die rode strepen door de cel zelf zou verwachten en wat minder fel rode kleuring over het membraan van de cel zelf. (Niet voldoende antigen retrieval uitgevoerd of gewassen?) De fel rode rand lijkt namelijk een beetje aspecifieke plak?

Heerlijk dit soort plaatjes.

[ Bericht 7% gewijzigd door NaturalScience op 15-12-2013 12:48:31 ]

quote:

Op zondag 15 december 2013 12:43 schreef NaturalScience het volgende:

[..]

Wat voor cel dit is durf ik ook niet te zeggen. Maar het zou me niets verbazen als dit gewoon een Hela cel is (kankerlijn van endometrium weefsel).

Voor iedereen die met HeLa cellen werkt is dit boek wel een must-read vind ik:
The immortal life of Henrietta Lacks

[ Bericht 0% gewijzigd door MissGump op 15-12-2013 21:24:09 ]

HeLa de bekendste maar er zijn natuurlijk veel meer lijnen waarvan de afkomst ethisch gezien niet helemaal klopt.

Wetenschappelijke waarde van dit soort cellijnen, die al honderden keren zijn ge-passaged, is vrij beperkt als je het mij vraagt. Lijkt niet echt meer op in vivo kanker.

quote:

Op zaterdag 14 december 2013 09:54 schreef Claudia_x het volgende:

[..]

Overigens zie ik dat niet zozeer als hogere eisen maar als andere eisen. Je moet al die eisen bezien in het licht van de wetenschappelijke cultuur en tradities. Bij ons is het gebruikelijk om longitudinaal onderzoek te doen, drie jaar lang veldwerk te verrichten en om vier inhoudelijk omvangrijke artikelen te schrijven, hooguit vijf. De publicatiekansen zijn bovendien heel klein.

goed punt, ga ik in mee .

quote:

Op zaterdag 14 december 2013 19:05 schreef Bosbeetle het volgende:

[..]

Nope niet confocaal, super-resolutie (SIM) in rood is actin en in groen is vinculin.

quote:

Op zaterdag 14 december 2013 19:27 schreef Bram_van_Loon het volgende:
Oké, ik kan het niet laten om het te vragen. Wat (wat voor cel? Wat is groen/rood/geel gekleurd?) zien we precies op deze foto?

dendritische cel

[ Bericht 0% gewijzigd door Bosbeetle op 16-12-2013 00:08:41 ]

quote:

Op zondag 15 december 2013 12:43 schreef NaturalScience het volgende:

[..]

Wat voor cel dit is durf ik ook niet te zeggen. Maar het zou me niets verbazen als dit gewoon een Hela cel is (kankerlijn van endometrium weefsel).

Maar actine is gewoon een eiwit/onderdeel van het cytostekel van de cel. (Het kleurpatroon lijkt trouwens op F-actine?) Dat groene G gevormde ding is dus vinculin een adhesiemolecuul/membraaneiwit van de cel.

Een gele kleuring zit hier niet in. Interessant in dit plaatje is wel dat er geen DAPI kleuring is gebruikt om de kern aan te kleuren (in blauw).

Nu ik weet dat rood actine is vraag ik me wel af in hoeverre bosbeetle het rode signaal heeft weggefilterd aangezien je bij actine veel meer van die rode strepen door de cel zelf zou verwachten en wat minder fel rode kleuring over het membraan van de cel zelf. (Niet voldoende antigen retrieval uitgevoerd of gewassen?) De fel rode rand lijkt namelijk een beetje aspecifieke plak?

Heerlijk dit soort plaatjes.

Niets weggewassen, de F-actine zit in die rode kernen van de podosomen en in stress-fibers aan de rand van de cellen. Die spotjes in de G zijn podosomen (google maar eens images op podosomen) een plek waar als er geen glas zou zitten de cel lange uitstekers zou maken om zo de extracellulaire matrix te invaseren. Het is dus niet confocaal maar heeft wel "optical sectioning" en het is idd 1 plakje van een grotere Z-stack.

En waarom zou er een DAPI kleuring bij moeten zitten, ik ben niet geďnteresseerd in de kern in dit specifieke geval

(trouwens samenwerking met: http://ncmls.nl/news/top-publications-on-podosomes/ zou leuk zijn als we er samen nog zo'n publicatie uit zouden kunnen halen, wij imagen op een stuk hogere resolutie voor livecell )

(als mensen dit zo leuk vinden kan ik ook mijn vrijdag de dertiende cellen laten zien)



3 cellen met paxillin en zyxin gekleurd, ze leven ook nog dus ik heb ook nog het filmpje dat deze drie cellen van elkaar 'weglopen'

[ Bericht 4% gewijzigd door Bosbeetle op 16-12-2013 00:06:11 ]