FOK!forum / Nieuws & Achtergronden / Herkenning dieren door eigen unieke DNA Barcode makkelijker
Lambiekjewoensdag 3 november 2010 @ 08:55
quote:
Call it a DNA digital Dewey Decimal System for all life on Earth.

Every species, from extinct to thriving, is set to get its own DNA barcode in an attempt to better track the ones that are endangered, as well as those being shipped across international borders as food or consumer products.

Researchers hope handheld mobile devices will be able to one day read these digital strips of rainbow-colored barcodes -- much like supermarket scanners -- to identify different species by testing tissue samples on site and comparing them with a digital database.

The International Barcode of Life Project (iBOL), which says it is the world's first reference library of DNA barcodes and the world's largest biodiversity genomics project, is being built by scientists using fragments of DNA to create a database of all life forms.

"What we're trying to do is to create this global library of DNA barcodes -- snippets, little chunks of DNA -- that permit us to identify species," Alex Smith, assistant professor of molecular ecology at the University of Guelph's Biodiversity Institute of Ontario, about 90 km (56 miles) west of Toronto.

So far DNA barcoding has helped identify the type of birds that forced last year's emergency landing of a flight on the Hudson River in New York. The researchers also discovered nearly one in four fish fillets are mislabeled in North America after referring to the library, which has 7,000 species of fish DNA barcodes, allowing the scientists to identify fillets that have been stripped of scales, skins and heads.

To get the barcodes, scientists use a short section of DNA extracted from a standardized region of tissue. Once the barcode is created, it's filed in the iBOL library.

Within a week, the barcode can be viewed publicly, online, by signing up for a free account at www.boldsystems.org, the site for Barcode of Life Datasystems (BOLD). Smith describes it as being like a label on a filing cabinet.

Just as the barcode scanner at a grocery store can identify lettuce, milk or steak, the DNA barcode sequence can be used to identify different species so that anyone who isn't a specialist -- from an elementary school student to a border patrol inspector -- can identify the species, once technology to read the library is available.

The library has more than 87,000 formally described species with barcodes filed and more than 1 million total barcoded specimens.

Smith said humans live among at least 1.9 million named species, with total diversity within all those species adding up to millions more. Scientists estimate iBOL will have barcodes for all 10 million species of multicellular life within the next 20 years.

While the library is based in Canada, which led the early stages of DNA barcoding, 25 other countries are also involved.

"Most of life on the planet is not polar bears and Siberian tigers -- most of life on the planet weighs less than a gram, is less than a centimeter long, and isn't visual. It experiences the world through taste and smell and we're not aware of its existence," Smith said.

Aside from saving polar bears or tigers from extinction, the library is meant to help with more routine aspects of the global economy. That includes jobs such as ensuring the salmon or trout in markets and restaurants is accurately identified, or determining whether foods or other animal products crossing international borders are what they are claimed to be.

Smith said the barcodes will dramatically cut the time food shipments are held up at borders if technology to read the barcodes is available to determine whether a suspected pest on board is harmful.
Wetenschap is de weg kwijt.
IHVKwoensdag 3 november 2010 @ 09:03
Want? Privacy van dieren is in het geding ? :')
DroogDokwoensdag 3 november 2010 @ 09:05
Een soort Star-Trek tricorder idee?
twiFightwoensdag 3 november 2010 @ 09:27
Ontwikkelingen hieraan zijn wel op meer vlakken gaande, onder andere ook op het gebied van genetische diversiteit, m.a.w. dat dieren met zo verschillend mogelijk DNA met elkaar gaan paren zodat je sterk nageslacht krijgt (het tegenovergestelde van inteelt).

Ik vraag me af hoe het met de kosten zit. DNA kitjes zijn nog altijd niet goedkoop en iemand zal dat moeten betalen.
Eyjafjallajoekullwoensdag 3 november 2010 @ 09:46
Nog niet goedkoop. Over een aantal jaar kan je binnen 3 seconde iemands DNA aflezen met een sensortje van 3 euro.
twiFightwoensdag 3 november 2010 @ 09:52
Dat zou je nog tegenvallen ;) Nu scheelt het al een hoop als je een standaard stukje weefsel (en waarschijnlijk dus een voldoende hoeveelheid) afneemt bij dieren, zoals in het artikel staat, want dat bespaard je chemicalien voor een PCR, die je bij recherchewerkzaamheden nog wel nodig zou hebben. Dat soort chemicalien kunnen in de duizenden euros lopen. Maar ook gebruikelijke DNA kitjes voor mensen lopen nog in de honderden euros (kun je geloof ik een stuk of 10 profiles mee doen), die zullen niet snel op enkele euros uitkomen. Sensors zal ook niet lukken, omdat het DNA 'losgemaakt' moet worden en het profileren met stroom gebeurt. Je gaat niet een stuk weefsel oplossen en onder stroom zetten in een levend wezen.
HostiMeisterwoensdag 3 november 2010 @ 10:33
Vette shit :Y
Snap Lambiekjes probleem niet.
bas-beestwoensdag 3 november 2010 @ 16:02
Waarom is de wetenschap dan de weg kwijt? Is het zo erg dat ze o.a. bedreigde diersoorten willen kunnen filteren?
Gulowoensdag 3 november 2010 @ 19:38
quote:
Op woensdag 3 november 2010 09:03 schreef IHVK het volgende:
Want? Privacy van dieren is in het geding ? :')
Haha, dat niet. Het punt is echter dat bepaalde multinationals straks DNA kunnen gaan patenteren. Dat betekent dat zij daarmee formeel het patentrecht hebben op miljoenen dieren.

Dat lijkt me niet wenselijk.
Resistorwoensdag 3 november 2010 @ 19:40
Makkelijker dan ieder dier een eigen naam te geven. Dat zie je al veel bij aquariumvissen, die hebben een nummer.
twiFightwoensdag 3 november 2010 @ 22:03
quote:
1s.gif Op woensdag 3 november 2010 19:38 schreef Gulo het volgende:

[..]

Haha, dat niet. Het punt is echter dat bepaalde multinationals straks DNA kunnen gaan patenteren. Dat betekent dat zij daarmee formeel het patentrecht hebben op miljoenen dieren.

Dat lijkt me niet wenselijk.
Wake up! :) Pharmaceuticals hebben NU AL patent op menselijke genomen. Aan de ene kant wel logisch, want zij steken miljoenen in onderzoek daarna, daarentegen kun je je afvragen of een 'stukje mens' wel te claimen is. Ze kunnen moeilijk ieder persoon op aarde aanklagen omdat we zo'n gen hebben :p

Overigens lees ik uit de bron niet dat zij patenten claimen op dieren, hooguit op de database van DNA profielen. En dat is heel logisch, dat gebeurt met al het DNA.
Salvad0Rwoensdag 3 november 2010 @ 22:04
Je hebt nu al Monsanto etc die de natuur drastisch verleppen met hun genetisch gemodificeerde zalm en virusresistente gewassen die maar één generatie meegaan, etc.

:r
Dagonetwoensdag 3 november 2010 @ 22:16
quote:
1s.gif Op woensdag 3 november 2010 10:33 schreef HostiMeister het volgende:
Vette shit :Y
Snap Lambiekjes probleem niet.
Omdat, aan de TT te zien, Lambiekje denkt dat elk dier nu een barcode in het DNA geprint krijgt.
Dagonetwoensdag 3 november 2010 @ 22:19
quote:
1s.gif Op woensdag 3 november 2010 22:03 schreef twiFight het volgende:

Overigens lees ik uit de bron niet dat zij patenten claimen op dieren, hooguit op de database van DNA profielen. En dat is heel logisch, dat gebeurt met al het DNA.
Dat gebeurt met alle databases, da's niet eens patent maar gewoon auteursrecht.
Je kan ook niet zomaar het telefoonboek kopiëren.
bas-beestwoensdag 3 november 2010 @ 22:37
quote:
4s.gif Op woensdag 3 november 2010 22:04 schreef Salvad0R het volgende:
Je hebt nu al Monsanto etc die de natuur drastisch verleppen met hun genetisch gemodificeerde zalm en virusresistente gewassen die maar één generatie meegaan, etc.

:r
Daar heeft het artikel uit de OP ook echt mee te maken...