abonnement Unibet Coolblue Bitvavo
pi_76365643
Ik heb die 100gb gewoon geen bestandssysteem gegeven waardoor ik een andere optie kreeg. Veel makkelijker.

Ripped her heart out right before her eyes! Eyes over easy, eat it! Eat it! Eat it!
  zondag 3 januari 2010 @ 17:54:26 #142
158136 Joooo-pi
Do you want a balloon...
pi_76365807
Ik ben er wel achter dat je altijd "specify manually" moet doen.

[ Bericht 1% gewijzigd door Joooo-pi op 03-01-2010 18:08:46 ]
heitieh
  zondag 3 januari 2010 @ 18:02:00 #143
282039 VanderMeulen
Mjam mjam mjam mjam, hap hap
pi_76366094
quote:
Op zondag 3 januari 2010 17:54 schreef Joooo-pi het volgende:
Ik ben er wel achter dan je altijd "specify manually" moet doen.
't is inderdaad jammer dat de standaardopties /home niet op een aparte partitie zetten. Dat werkt namelijk zoveel makkelijker!
Heeft u al een brandverzekering?
pi_76369180
quote:
Op zondag 3 januari 2010 18:02 schreef VanderMeulen het volgende:

[..]

't is inderdaad jammer dat de standaardopties /home niet op een aparte partitie zetten. Dat werkt namelijk zoveel makkelijker!
Omdat?
Eins, zwei, hoeplakai.
pi_76370015
quote:
Op zondag 3 januari 2010 19:14 schreef jakkop het volgende:

[..]

Omdat?
Dan kun je een complete reinstall doen zonder dat je persoonlijke instellingen of je data verdwijnen.

Ik heb zelf mijn hele /home partitie op een aparte schijf staan. Toevallig is gisteren die schijf gecrashed. Gelukkig had ik een volledige backup dus die heb ik op een nieuwe schijf gezet, deze in de machine gehangen, even /etc/fstab editen, en toen draaide alles weer, alsof er niks was gebeurd.
  zondag 3 januari 2010 @ 20:04:23 #146
164290 ouderejongere
jemig de pemig !
pi_76371297
quote:
Op zondag 3 januari 2010 19:14 schreef jakkop het volgende:

[..]

Omdat?
Zoals mijn voorganger al zegt. Eigenlijk geldt dit voor alle OS'en, ook voor windhoos, na installatie meteen documenten op andere partitie en ook toepassingen zo veel mogelijk op die partitie zetten, dan kan je het systeem klein houden (klein backupt sneller)
Jezus redt
[-== Arch Linux ==-]
  zondag 3 januari 2010 @ 20:42:12 #147
282039 VanderMeulen
Mjam mjam mjam mjam, hap hap
pi_76373125
Precies, je kunt je hele installatie vernuecken, herinstalleren of zelfs een compleet andere distributie installeren, en als je computer weer draait is het alsof er niets gebeurd is.
Heeft u al een brandverzekering?
pi_76392396
Ik probeer een fasta file te splitsen in linux door gebruik te maken van het commando 'awk'.
vb fasta file:
1
2
3
4
5
6
>1346493
CTGCAGTATTTATTTCCTCCTGCCTTATTAA
>1346494
ACCTCCTAGTGATCGTACTCGTGATGTGCTGTAC
>1346495
ACGTGATGCTGTGATCGGCTATGTTGCTGTAT


Dit voorbeeld wil ik splitsen in drie files met de naam achter de '>' (met extensie .fas of .fasta) en in de file
>naam
ACTG tekst

Had op internet het volgende gevonden:
awk '/^/{f=++d".fasta"} {print > f}' <inputfile>

Dit werkt prima alleen krijg ik dus volgnummers als .fasta files. Ik wil geen volgnummers maar de naam die achter de '>' staat. Wie heeft de gouden tip :s)
pi_76417111
quote:
Op maandag 4 januari 2010 11:28 schreef geelkuikentje het volgende:
Ik probeer een fasta file te splitsen in linux door gebruik te maken van het commando 'awk'.
vb fasta file:
[ code verwijderd ]

Dit voorbeeld wil ik splitsen in drie files met de naam achter de '>' (met extensie .fas of .fasta) en in de file
>naam
ACTG tekst

Had op internet het volgende gevonden:
awk '/^/{f=++d".fasta"} {print > f}' <inputfile>

Dit werkt prima alleen krijg ik dus volgnummers als .fasta files. Ik wil geen volgnummers maar de naam die achter de '>' staat. Wie heeft de gouden tip :s)
Geen awk, maar dit stukje Perl doet het ook:

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
#!/usr/bin/perl

$infile = shift;

open(FILE, "< $infile") or die "Couldn't open file $infile";

$fileName, $inLine, $outLine;

while (<FILE>) {
        $line = $_;

        ($fileName,) = ($line =~ m/^>(.*)$/m);

        if ($fileName ne "") {
                open(OUT, "> $fileName.fasta");
                next;
        } else {
                ($outLine,) = ($line =~ m/^(.*)$/m);
                print OUT $outLine;
                close(OUT);
        }
}

exit(0)
  maandag 4 januari 2010 @ 22:12:02 #150
147503 Iblis
aequat omnis cinis
pi_76418038
Ik heb alle vertrouwen in de Perl-versie van hierboven, maar als je het met AWK wilt, kan het volgens mij zo:

1awk '/^>[0-9]+/ {f=substr($0, 2) ".fasta"} !/^>[0-9]+/{print > f}' <inputfile>
Daher iſt die Aufgabe nicht ſowohl, zu ſehn was noch Keiner geſehn hat, als, bei Dem, was Jeder ſieht, zu denken was noch Keiner gedacht hat.
pi_76420966
Ga beide opties zo even proberen, iig bedankt
pi_76421064
Na GIMP, Vdub, OpenOffice etc gebruikt te hebben, heb ik voor de nieuwsgierigheid gekeken naar Ubuntu (met LiveCD). Maar het was te moeilijk voor mij. Ik wist niet eens hoe je een MP3 moest afspelen of VLC runnen/installeren.

Heb wel respect voor Ubuntu
  woensdag 6 januari 2010 @ 21:07:30 #153
262232 Stoomboot
Drijft alleen op beton
pi_76500216
TS, http://www.pcbsd.org/
PC-BSD: FreeBSD voor nubs
Bel Carglass zodra u een sterretje... *pats*
  woensdag 6 januari 2010 @ 21:12:42 #154
107418 wdn
Elfen lied O+
pi_76500442
quote:
Op maandag 4 januari 2010 23:14 schreef SonyTRV420E het volgende:
Na GIMP, Vdub, OpenOffice etc gebruikt te hebben, heb ik voor de nieuwsgierigheid gekeken naar Ubuntu (met LiveCD). Maar het was te moeilijk voor mij. Ik wist niet eens hoe je een MP3 moest afspelen of VLC runnen/installeren.

Heb wel respect voor Ubuntu[ afbeelding ]
mp3: klikken op de file is voldoende Mochten er codecs geinstalleerd moeten worden dan zorgt het systeem daar voor door een voorstel te doen.

en vlc installeren: applications -> Ubuntu software center -> vlc zoeken en installeren.
Beatus vir qui suffert tentationem.
PSN Rinzewind en Cadsuana Melaidhrin
Stellar Blade *O* Sea of Stars *O* Trails Daybreak *O*
  donderdag 7 januari 2010 @ 10:21:42 #155
158136 Joooo-pi
Do you want a balloon...
pi_76514057
quote:
Op maandag 4 januari 2010 23:14 schreef SonyTRV420E het volgende:
Na GIMP, Vdub, OpenOffice etc gebruikt te hebben, heb ik voor de nieuwsgierigheid gekeken naar Ubuntu (met LiveCD). Maar het was te moeilijk voor mij. Ik wist niet eens hoe je een MP3 moest afspelen of VLC runnen/installeren.

Heb wel respect voor Ubuntu[ afbeelding ]
Door windows ben je gewend geraakt om moeilijk te denken

Heb je niet een oude pc staan? Installeer daarop ubuntu om wat mee om te knoeien. Heb ik ook, alleen nu gebruik ik die pc vaker dan mijn gewone
heitieh
pi_76514814
quote:
Op maandag 4 januari 2010 23:12 schreef geelkuikentje het volgende:
Ga beide opties zo even proberen, iig bedankt
Het werkte niet helemaal maar heb iets gevonden om fasta files te splitsen:
bp_seqretsplit van BioPerl. Dat doet exact wat ik wil
  donderdag 7 januari 2010 @ 11:06:34 #157
187069 slacker_nl
Sicko pur sang
pi_76515507
quote:
Op woensdag 6 januari 2010 21:07 schreef Stoomboot het volgende:
TS, http://www.pcbsd.org/
PC-BSD: FreeBSD voor nubs
Voor noobs? Tis gewoon een desktop variant van FreeBSD voor zover ik begrepen heb.
In theory there is no difference between theory and practice. In practice there is.
  donderdag 7 januari 2010 @ 15:12:28 #158
66470 Klonk
Koning van Tofania
pi_76524177
quote:
Op donderdag 7 januari 2010 10:21 schreef Joooo-pi het volgende:

[..]

Door windows ben je gewend geraakt om moeilijk te denken

Heb je niet een oude pc staan? Installeer daarop ubuntu om wat mee om te knoeien. Heb ik ook, alleen nu gebruik ik die pc vaker dan mijn gewone
tijd om de rollen om te draaien
Klonk is alleen Klonk als er Klonk op staat
  donderdag 7 januari 2010 @ 17:14:41 #159
187069 slacker_nl
Sicko pur sang
pi_76528899
Windows op een oude PC is echt onbruikbaar, tenzij je win3.11 gebruikt
In theory there is no difference between theory and practice. In practice there is.
  donderdag 7 januari 2010 @ 17:43:52 #160
282039 VanderMeulen
Mjam mjam mjam mjam, hap hap
pi_76529843
quote:
Op maandag 4 januari 2010 23:14 schreef SonyTRV420E het volgende:
Na GIMP, Vdub, OpenOffice etc gebruikt te hebben, heb ik voor de nieuwsgierigheid gekeken naar Ubuntu (met LiveCD). Maar het was te moeilijk voor mij. Ik wist niet eens hoe je een MP3 moest afspelen of VLC runnen/installeren.

Heb wel respect voor Ubuntu[ afbeelding ]

1) Aanklikken in de desbetreffende map
2) Aanklikken in het softwarecentrum

Geen dank.
Heeft u al een brandverzekering?
abonnement Unibet Coolblue Bitvavo
Forum Opties
Forumhop:
Hop naar:
(afkorting, bv 'KLB')